XBP1

Ідентифікатори

Символи

XBP1, TREB5, XBP-1, XBP2, TREB-5, X-box binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 194355 MGI: 98970 HomoloGene: 3722 GeneCards: XBP1

Пов'язані генетичні захворювання

esophagus squamous cell carcinoma^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• estrogen receptor binding • protein homodimerization activity • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein heterodimerization activity • chromatin DNA binding • ubiquitin protein ligase binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • мембрана • integral component of membrane • нуклеоплазма • integral component of endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum membrane • цитоплазма • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро
Біологічний процес	• positive regulation of MHC class II biosynthetic process • positive regulation of protein phosphorylation • negative regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response • positive regulation of immunoglobulin production • muscle organ development • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • phosphatidylinositol 3-kinase signaling • GO:0097285 апоптоз • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of protein stability • glucose homeostasis • transcription, DNA-templated • cell growth • positive regulation of endothelial cell apoptotic process • response to unfolded protein • fatty acid biosynthetic process • protein transport • positive regulation of TOR signaling • exocrine pancreas development • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • диференціація клітин • positive regulation of autophagy • cellular response to laminar fluid shear stress • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • positive regulation of B cell differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to fluid shear stress • organelle organization • regulation of autophagy • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • positive regulation of plasma cell differentiation • positive regulation of T cell differentiation • positive regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response • positive regulation of histone methylation • lipid metabolism • epithelial cell maturation involved in salivary gland development • positive regulation of protein acetylation • positive regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • автофагія • multicellular organism development • ATF6-mediated unfolded protein response • IRE1-mediated unfolded protein response • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • epithelial cell maturation • cellular response to oxidative stress • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus • protein destabilization • cellular response to peptide hormone stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • adipose tissue development • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration • liver development • cellular triglyceride homeostasis • cholesterol homeostasis • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • positive regulation of lactation • cellular response to amino acid stimulus • Ангіогенез • cellular response to glucose starvation • response to insulin-like growth factor stimulus • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • fatty acid homeostasis • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • positive regulation of hepatocyte proliferation • sterol homeostasis • cellular response to interleukin-4 • positive regulation of protein kinase B signaling • ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of fat cell differentiation • negative regulation of apoptotic process • endothelial cell proliferation • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cell population proliferation • negative regulation of myotube differentiation • positive regulation of cell migration • Відповідь на незгорнуті білки • cellular response to nutrient • cellular response to insulin stimulus • response to endoplasmic reticulum stress • positive regulation of vascular wound healing • positive regulation of angiogenesis • neuron development • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to fructose stimulus • cellular response to glucose stimulus • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in unfolded protein response • cellular response to leukemia inhibitory factor • positive regulation of protein import into nucleus • regulation of cell growth
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7494


22433

Ensembl


ENSG00000100219


ENSMUSG00000020484

UniProt


P17861


O35426

RefSeq (мРНК)


NM_005080 NM_001079539 NM_001393999 NM_001394000


NM_001271730 NM_013842

RefSeq (білок)


NP_001073007 NP_005071


NP_001258659 NP_038870

Локус (UCSC)

Хр. 22: 28.79 – 28.8 Mb

Хр. 11: 5.47 – 5.48 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

XBP1 (англ. X-box binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 28 695^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVVVAAAPNP	ADGTPKVLLL	SGQPASAAGA	PAGQALPLMV	PAQRGASPEA
ASGGLPQARK	RQRLTHLSPE	EKALRRKLKN	RVAAQTARDR	KKARMSELEQ
QVVDLEEENQ	KLLLENQLLR	EKTHGLVVEN	QELRQRLGMD	ALVAEEEAEA
KGNEVRPVAG	SAESAALRLR	APLQQVQAQL	SPLQNISPWI	LAVLTLQIQS
LISCWAFWTT	WTQSCSSNAL	PQSLPAWRSS	QRSTQKDPVP	YQPPFLCQWG
RHQPSWKPLM	N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, транспорт, транспорт білків, відповідь на порушення конформації білку, ангіогенез, автофагія, біосинтез ліпідів, диференціація клітин, міогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Yoshida H., Matsui T., Yamamoto A., Okada T., Mori K. (2001). XBP1 mRNA is induced by ATF6 and spliced by IRE1 in response to ER stress to produce a highly active transcription factor. Cell. 107: 881—891. PMID 11779464 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00611-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ono S.J., Liou H.C., Davidon R., Strominger J.L., Glimcher L.H. (1991). Human X-box-binding protein 1 is required for the transcription of a subset of human class II major histocompatibility genes and forms a heterodimer with c-fos. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4309—4312. PMID 1903538 DOI:10.1073/pnas.88.10.4309
Clauss I.M., Chu M., Zhao J.-L., Glimcher L.H. (1996). The basic domain/leucine zipper protein hXBP-1 preferentially binds to and transactivates CRE-like sequences containing an ACGT core. Nucleic Acids Res. 24: 1855—1864. PMID 8657566 DOI:10.1093/nar/24.10.1855
Sriburi R., Jackowski S., Mori K., Brewer J.W. (2004). XBP1: a link between the unfolded protein response, lipid biosynthesis, and biogenesis of the endoplasmic reticulum. J. Cell Biol. 167: 35—41. PMID 15466483 DOI:10.1083/jcb.200406136
Yoshida H., Nadanaka S., Sato R., Mori K. (2006). XBP1 is critical to protect cells from endoplasmic reticulum stress: evidence from Site-2 protease-deficient Chinese hamster ovary cells. Cell Struct. Funct. 31: 117—125. PMID 17110785 DOI:10.1247/csf.06016

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з XBP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12801 (англ.) . Архів оригіналу за 27 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P17861 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма