FOXF1

FOXF1
Ідентифікатори
Символи FOXF1, ACDMPV, FKHL5, FREAC1, forkhead box F1
Зовнішні ІД OMIM: 601089 MGI: 1347470 HomoloGene: 1114 GeneCards: FOXF1
Пов'язані генетичні захворювання
alveolar capillary dysplasia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

transcription regulator complex
клітинне ядро

Біологічний процес

somitogenesis
regulation of smooth muscle cell differentiation
renal system development
ureter development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
lung morphogenesis
embryonic foregut morphogenesis
lung development
positive regulation of cell migration
endocardial cushion development
GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
extracellular matrix organization
cardiac left ventricle morphogenesis
in utero embryonic development
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of mast cell degranulation
smooth muscle cell differentiation
morphogenesis of a branching structure
venous blood vessel development
cellular response to cytokine stimulus
right lung morphogenesis
transcription, DNA-templated
васкулогенез
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
respiratory tube development
heart development
determination of left/right symmetry
establishment of epithelial cell apical/basal polarity
blood vessel development
embryonic ectodermal digestive tract morphogenesis
positive regulation of mesenchymal cell proliferation
embryonic digestive tract morphogenesis
animal organ morphogenesis
pancreas development
detection of wounding
mesenchyme migration
smoothened signaling pathway
lateral mesodermal cell differentiation
lung alveolus development
digestive tract development
lung vasculature development
mesoderm development
epithelial tube branching involved in lung morphogenesis
negative regulation of inflammatory response
lung lobe morphogenesis
ductus arteriosus closure
embryonic digestive tract development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development
midgut development
positive regulation of cell-substrate adhesion
transcription by RNA polymerase II
диференціація клітин
cell-cell adhesion
trachea development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2294
15227
Ensembl
ENSG00000103241
ENSMUSG00000042812
UniProt
Q12946
Q61080
RefSeq (мРНК)
NM_001451
NM_010426
RefSeq (білок)
NP_001442
NP_034556
Локус (UCSC) Хр. 16: 86.51 – 86.52 Mb Хр. 8: 121.81 – 121.81 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FOXF1 (англ. Forkhead box F1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 40 122[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSAPEKQQPPHGGGGGGGGGGGAAMDPASSGPSKAKKTNAGIRRPEKPP
YSYIALIVMAIQSSPTKRLTLSEIYQFLQSRFPFFRGSYQGWKNSVRHNL
SLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQA
LKPMYSMMNGLGFNHLPDTYGFQGSAGGLSCPPNSLALEGGLGMMNGHLP
GNVDGMALPSHSVPHLPSNGGHSYMGGCGGAAAGEYPHHDSSVPASPLLP
TGAGGVMEPHAVYSGSAAAWPPSASAALNSGASYIKQQPLSPCNPAANPL
SGSLSTHSLEQPYLHQNSHNAPAELQGIPRYHSQSPSMCDRKEFVFSFNA
MASSSMHSAGGGSYYHQQVTYQDIKPCVM

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Hellqvist M., Mahlapuu M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1996). Differential activation of lung-specific genes by two forkhead proteins, FREAC-1 and FREAC-2. J. Biol. Chem. 271: 4482—4490. PMID 8626802 DOI:10.1074/jbc.271.8.4482
  • Mahlapuu M., Pelto-Huikko M., Aitola M., Enerbaeck S., Carlsson P. (1998). FREAC-1 contains a cell-type-specific transcriptional activation domain and is expressed in epithelial-mesenchymal interfaces. Dev. Biol. 202: 183—195. PMID 9769171 DOI:10.1006/dbio.1998.9010
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J. 13: 5002—5012. PMID 7957066

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з FOXF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3809 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, Q12946 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші