Excavata

Excavata
Rentang fosil: Neoproterozoikum–sekarang
Had'n
Arkean
Proterozoikum
Pha.
Giardia lamblia, diplomonad parasit
Klasifikasi ilmiah
Domain:
Eukaryota
(tanpa takson):
Excavata

(Cavalier-Smith) Simpson, 2003
Filum

Metamonada
Loukozoa
Euglenozoa
Percolozoa

Excavata adalah kumpulan utama dari eukariota[1] bersel satu.[2] Kategori filogenetik Excavata terdiri atas bermacam-macam bentuk yang hidup bebas atau bersimbiosis dan termasuk beberapa parasit manusia yang penting.

Ciri-ciri

Banyak excavata telah kehilangan mitokondria 'klasik' - organisme ini sering disebut 'amitokondriata' (yang berarti 'tidak bermitokondria'), meski kebanyakan, mungkin semua, tetap memiliki organel mitokondia dalam bentuk yang sangat termodifikasi. Yang lainnya memiliki mitokondria dengan krista tubuler, diskoid atau lembaran dalam kasus tertentu. Banyak excavates memiliki dua, empat atau lebih flagel[3] dan banyak yang mempunyai lekukan makanan ventral yang mencolok dengan ultrastruktur khas ditunjang oleh mikrotubulus.[4] Akan tetapi, bermacam kelompok yang tidak punya ciri ini dianggap sebagai excavata berdasarkan bukti genetis (terutama pohon filogenetik dari sekuensi molekuler).

Pengelompokan

Excavata diklasifikasikan menjadi empat kelompok utama pada tingkat filum atau superfilum. Ini ditunjukkan oleh tabel di bawah ini.

Superfilum Filum Genera Representatif Deskripsi
Discoba Euglenozoa contoh Euglena, Trypanosoma Banyak parasit penting, satu kelompok yang berplastida (kloroplas).
Percolozoa (Heterolobosea) contoh Naegleria, Acrasis Banyak yang berganti-ganti bentuk antara bentuk berflagel dan amoeboid (mirip amoeba).
Loukozoa (Jakobida) contoh Jakoba, Reclinomonas Hidup bebas, kadang-kadang berflagel lorikat. Beberapa anggotanya amitokondriata.
Metamonada Preaxostyla contoh Oxymonads, Trimastix Flagelata amitokontriata, ada yang hidup bebas (Trimastix) atau hidup di usus belakang serangga
Fornicata contoh Giardia, Carpediemonas Amitokondriata, kebanyakan bersimbiosis dan parasit binatang.
Parabasalia contoh Trichomonas Flagelata amitokontriata, biasanya komensal di usus serangga. Beberapa penyebab penyakit manusia.

Heterolobosea (Percolozoa) dan Euglenozoa tampaknya berhubungan dan disatukan oleh keberadaan krista diskoid dalam mitokondrianya (Superfilum Discicristata). Baru-baru ini hubungan erat telah ditunjukkan antara Discicristata dan Jakobida.[5] Kebanyakan jakobida berkrista tubuler, seperti kebanyakan protista lain, sedangkan metamonada tidak biasa karena kehilangan mitokondria klasiknya; sebagai gantinya, mereka memiliki 'hidrogenosom', 'mitosom' atau organel tak berciri. Selain grup pada tabel di atas, genus Malawimonas umumnya dianggap sebagai anggota Excavata karena morfologi excavatanya yang khas dan keterkaitan filogenetis dengan grup-grup excavata pada beebrapa filogeni molekuler. namun, kedudukannya di antara excavata belum dipahami.

kekerabatan excavata belum pasti; mungkin mereka bukan kelompok yang monofiletik. kemonofiletikan excavata jauh dari kejelasan, meskipun kelihatannya ada beberapa klad dalam excavata yang monofiletik.[6]

Excavata tertentu sering dianggap eukariota primitif, sebagian berdasarkan penempatan mereka pada banyak pohon evolusioner. hal ini dapat mendorong usulan bahwa excavata adalah tingkat parafiletik yang termasuk moyang dari eukariota yang hidup sekarang. Namun penempatan excavata tertentu sebagai 'cabang awal' mungkin merupakan artifak analisis yang diakibatkan oleh tarikan cabang panjang, seperti yang telah dilihat pada beberapa grup lain, contohnya, microsporidia.

Rujukan

  1. ^ Hampl V, Hug L, Leigh JW; et al. (2009). "Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups"". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (10): 3859–64. doi:10.1073/pnas.0807880106. PMID 19237557.  Parameter |month= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)Pemeliharaan CS1: Penggunaan et al. yang eksplisit (link) Pemeliharaan CS1: Banyak nama: authors list (link)
  2. ^ Simpson, Ag; Inagaki, Y; Roger, Aj (2006), "Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of "primitive" eukaryotes" (Free full text), Molecular biology and evolution, 23 (3): 615–25, doi:10.1093/molbev/msj068, PMID 16308337  Parameter |month= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)Pemeliharaan CS1: Banyak nama: authors list (link)
  3. ^ Simpson AG (2003). "Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota)". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 53 (Pt 6): 1759–77. doi:10.1099/ijs.0.02578-0. PMID 14657103. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2012-12-09. Diakses tanggal 2009-04-07.  Parameter |month= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)
  4. ^ Cavalier-Smith T (2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 2): 297–354. PMID 11931142. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2017-07-29. Diakses tanggal 2009-04-07.  Parameter |month= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)
  5. ^ Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Henner Brinkmann, Gertraud Burger, Andrew J. Roger, Michael W. Gray, Hervé Philippe, and B. Franz Lang (August 2007). "Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans". Curr. Biol. 17 (16): 1420–1425. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961. Pemeliharaan CS1: Banyak nama: authors list (link)
  6. ^ Laura Wegener Parfrey, Erika Barbero, Elyse Lasser, Micah Dunthorn, Debashish Bhattacharya, David J Patterson, and Laura A Katz (December 2006). "Evaluating Support for the Current Classification of Eukaryotic Diversity". PLoS Genet. 2 (12): e220. doi:10.1371/journal.pgen.0020220. PMID 17194223. Pemeliharaan CS1: Banyak nama: authors list (link)

Pranala luar

  • Tree of Life Eukaryotes Diarsipkan 2012-01-29 di Wayback Machine.
  • Tree of Life: Jakobida
  • Tree of Life: Fornicata
  • l
  • b
  • s
Klasifikasi Eukariota
Domain
Arkea
Bakteria
Eukaryota
(Kerajaan
Tumbuhan
Hacrobia
Heterokontophyta
Alveolata
Rhizaria
Excavata
Amoebozoa
Hewan
Fungi)
Amorphea
Amoebozoa
   Obazoa   
Opisthokonta
Holomycota
   Holozoa   
  • Tunicaraptor
  • Bicellum
  • Ichthyosporea
  • Pluriformea
Filozoa
  • Filasterea
Choanozoa
Diaphoretickes
  • Provora
Haptista
    TSAR    
  • Telonemia
     SAR     
Rhizaria
Alveolata
Myzozoa
Stramenopila
  • Platysulcus
Bigyra
  • Bicosoecida
  • Placidozoa
  • Sagenista
Gyrista
     CAM     
Pan-Cryptista
  • Microheliella
Cryptista
  • Palpitomonas
  • Katablepharida
  • Cryptophyta
Archaeplastida
Viridiplantae
(tumbuhan sensu lato)
Streptophyta
Excavates*
Discoba
  • Jakobida
  • Tsukubamonas
Discicristata
Metamonada
  • Barthelona
  • Anaeramoebae
  • Anaeromonada
  • Fornicata
  • Parabasalia
Malawimonada
  • Malawimonadidae
  • Imasidae
Incertae sedis
Hemimastigophora
  • Spironemidae
  • Spironematellidae
Ancyromonadida
  • Ancyromonadidae
  • Planomonadidae
CRuMs
  • Collodictyonidae
  • Mantamonadida
  • Rigifilida
  • l
  • b
  • s
Excavata
Domain
Arkea
Bakteria
Eukaryota
(Kerajaan
Tumbuhan
Hacrobia
Heterokontophyta
Alveolata
Rhizaria
Excavata
Amoebozoa
Hewan
Fungi)
Discoba
Discicristata
Euglenozoa
Percolozoa
Heterolobosea
  • Schizopyrenida: Vahlkampfiidae
    • Naegleria
    • Neovahlkampfia
    • Paravahlkampfia
    • Psalteriomonas
    • Sawyeria
    • Tetramitus/Paratetramitus
    • Vahlkampfia
    • Willaertia
  • Gruberellidae
    • Stachyamoeba
  • Rosculus
  • Acrasidae
    • Acrasis
  • Heteramoeba
  • Learamoeba
  • Monopylocystis
  • Stygamoeba
Percolatea
  • Percolomonas
  • Stephanopogon
Loukozoa/Jakobea
Andaluciida
  • Andalucia
Jakobida
  • Jakobidae
    • Jakoba
  • Histionidae
    • Reclinomonas
    • Histiona
M+M
Metamonad
Trichozoa
Parabasalidea
Fornicata
Eopharingia
  • Retortamonadida
    • Chilomastix
    • Retortamonas
Lain-lain
  • Carpediemonadida
    • Carpediemonas
  • Dysnectes
Anaeromonadea
  • Trimastix
  • Oxymonadida
    • Dinenympha
    • Pyrsonympha
    • Oxymonas
Lain-lain
  • Malawimonas
  • l
  • b
  • s
Indeks infeksi protozoa
Deskripsi
  • Alveolata
  • Amoebozoa
  • Excavata
  • Protista
Penyakit
  • Amoebozoa
  • Chromalveolata
  • Excavata
Pengobatan
  • Obat-obatan
    • amoeboa
    • chromalveolate
    • excavata
Pengidentifikasi takson