载脂蛋白L1

载脂蛋白L1
已知的結構
PDB人类UniProt搜索: PDBe RCSB
PDBID列表

7L6K、​7LF7、​7LFA、​7LFB、​7LFD

識別號
别名APOL1;, APO-L, APOL, APOL-I, FSGS4, apolipoprotein L1
外部IDOMIM:607254, ​603743 GeneCards:APOL1
相關疾病
focal segmental glomerulosclerosis 4, susceptibility to、​局部性腎絲球硬化症[1]
基因位置(人类
22號染色體
染色体22號染色體[2]
22號染色體
载脂蛋白L1的基因位置
载脂蛋白L1的基因位置
基因座22q12.3起始36,253,071 bp[2]
终止36,267,530 bp[2]
RNA表达模式
查阅更多表达数据
基因本體
分子功能 血浆蛋白结合
chloride channel activity
lipid binding
細胞組分 細胞外區域
intrinsic component of membrane
blood microparticle
very-low-density lipoprotein particle
high-density lipoprotein particle
細胞外空間
endoplasmic reticulum lumen
生物學過程 lipoprotein metabolic process
steroid metabolic process
lipid transport
先天免疫系統
cholesterol metabolic process
細胞溶解
受体介导的内吞作用
killing of cells of other organism
脂質代謝
翻译后修饰
chloride transmembrane transport
transport
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

8542

无数据

Ensembl

ENSG00000100342

无数据

UniProt

O14791

无数据

mRNA​序列
NM_001136540
​NM_001136541
​NM_003661
​NM_145343
​NM_145344

​NM_001362927

无数据

蛋白序列

NP_001130012
​NP_001130013
​NP_003652
​NP_663318
​NP_001349856

无数据

基因位置​(UCSC)Chr 22: 36.25 – 36.27 Mb无数据
PubMed​查找[3]无数据
維基數據
檢視/編輯人類

载脂蛋白L1(Apolipoprotein L1,常简写为ApoL1)是一系列被称为“载脂蛋白”的蛋白质中的一种。在人体中,它由位于22号染色体长臂的APOL1基因编码[4][5][6][7]。截至到2020年2月9日,已经发现了三种APOL1基因的剪切变异体(splicing variant),分别对应了载脂蛋白L1的三种同源异构体(isoform)[8]

结构

载脂蛋白L1的1型同源异构体由398个氨基酸构成;2型同源异构体由414个氨基酸构成;3型同源异构体由380个氨基酸构成。三个异构体的序列大同小异,二级结构也大体相同。均主要包含以下结构域(从N端到C端,以下以1型同源异构体为例)[9][10]

  • 1-27号氨基酸残基信号肽(signal peptide)
  • 60-237号残基:孔形成域(pore forming domain, PFD),其中包含一个9个氨基酸长度的BH3结构域(158-166号残基)
  • 238-304号残基:膜地址域(membrane addressing domain, MAD)
  • 339-398号残基:SRA相互作用域(SRA-interacting domain)

功能

相关疾病

参考文献

  1. ^ 與载脂蛋白L1相關的疾病;在維基數據上查看/編輯參考. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100342 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Duchateau PN, Pullinger CR, Orellana RE, Kunitake ST, Naya-Vigne J, O'Connor PM, Malloy MJ, Kane JP. Apolipoprotein L, a new human high density lipoprotein apolipoprotein expressed by the pancreas. Identification, cloning, characterization, and plasma distribution of apolipoprotein L. The Journal of Biological Chemistry. October 1997, 272 (41): 25576–82. PMID 9325276. doi:10.1074/jbc.272.41.25576. 
  5. ^ Page NM, Butlin DJ, Lomthaisong K, Lowry PJ. The human apolipoprotein L gene cluster: identification, classification, and sites of distribution. Genomics. May 2001, 74 (1): 71–8. PMID 11374903. doi:10.1006/geno.2001.6534. 
  6. ^ Pérez-Morga D, Vanhollebeke B, Paturiaux-Hanocq F, Nolan DP, Lins L, Homblé F, Vanhamme L, Tebabi P, Pays A, Poelvoorde P, Jacquet A, Brasseur R, Pays E. Apolipoprotein L-I promotes trypanosome lysis by forming pores in lysosomal membranes. Science. July 2005, 309 (5733): 469–72. PMID 16020735. doi:10.1126/science.1114566. 
  7. ^ Entrez Gene: APOL1 apolipoprotein L, 1. 
  8. ^ UniProtKB - O14791 (APOL1_HUMAN). https://www.uniprot.org/. [2020-02-27]. (原始内容存档于2021-04-23). 
  9. ^ UniProtKB - O14791 (APOL1_HUMAN). UniProt. [2020-02-27]. (原始内容存档于2021-04-23). 
  10. ^ Xiqian Lan; Hongxiu Wen; Rivka Lederman; Ashwani Malhotra; Joanna Mikulak; Waldemar Popik; Karl Skorecki; Pravin C. Singhal. Protein domains of APOL1 and Its Risk Variants. Exp Mol Pathol. 2015 August, 99 (1): 139–144. PMID 26091559. doi:10.1016/j.yexmp.2015.06.003.  请检查|date=中的日期值 (帮助)