SYPL1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SYPL1

Ідентифікатори

Символи

SYPL1, H-SP1, SYPL, synaptophysin like 1

Зовнішні ІД

OMIM: 616665 MGI: 108081 HomoloGene: 4915 GeneCards: SYPL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transporter activity • syntaxin-1 binding
Клітинна компонента	• Синаптичні бульбашки • secretory granule • cytoplasmic vesicle membrane • мембрана • Меланосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integral component of synaptic vesicle membrane • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • екзосома • synaptic vesicle membrane
Біологічний процес	• chemical synaptic transmission • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6856


19027

Ensembl


ENSG00000008282


ENSMUSG00000020570

UniProt


Q16563


O09117

RefSeq (мРНК)


NM_006754 NM_182715


NM_013635 NM_198710

RefSeq (білок)

NP_006745 NP_874384 NP_001368839 NP_001368840 NP_001368841
NP_001368842 NP_001368844 NP_001368845 NP_001368846 NP_001368847 NP_001368848 NP_001368849 NP_001368850


NP_038663 NP_942003

Локус (UCSC)

Хр. 7: 106.09 – 106.11 Mb

Хр. 12: 33 – 33.03 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYPL1 (англ. Synaptophysin like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 259 амінокислот, а молекулярна маса — 28 565^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPNIYLVRQ	RISRLGQRMS	GFQINLNPLK	EPLGFIKVLE	WIASIFAFAT
CGGFKGQTEI	QVNCPPAVTE	NKTVTATFGY	PFRLNEASFQ	PPPGVNICDV
NWKDYVLIGD	YSSSAQFYVT	FAVFVFLYCI	AALLLYVGYT	SLYLDSRKLP
MIDFVVTLVA	TFLWLVSTSA	WAKALTDIKI	ATGHNIIDEL	PPCKKKAVLC
YFGSVTSMGS	LNVSVIFGFL	NMILWGGNAW	FVYKETSLHS	PSNTSAPHSQ
GGIPPPTGI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

Leube R.E. (1994). Expression of the synaptophysin gene family is not restricted to neuronal and neuroendocrine differentiation in rat and human. Differentiation. 56: 163—171. PMID 8034131 DOI:10.1046/j.1432-0436.1994.5630163.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhong C.Z., Hayzer D.J., Runge M.S. (1992). Molecular cloning of a cDNA encoding a novel protein related to the neuronal vesicle protein synaptophysin. Biochim. Biophys. Acta. 1129: 235—238. PMID 1730063 DOI:10.1016/0167-4781(92)90495-L

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11507 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, Q16563 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2017. Процитовано 21 серпня 2017.