RCAN1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WEY

Ідентифікатори

Символи

RCAN1, ADAPT78, CSP1, DSC1, DSCR1, MCIP1, RCN1, regulator of calcineurin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602917 MGI: 1890564 HomoloGene: 3251 GeneCards: RCAN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase regulator activity • identical protein binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • central nervous system development • calcineurin-NFAT signaling cascade • кровообіг • GO:0072468 сигнальна трансдукція • calcium-mediated signaling • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of phosphoprotein phosphatase activity • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1827


54720

Ensembl


ENSG00000159200


ENSMUSG00000022951

UniProt


P53805


Q9JHG6

RefSeq (мРНК)

NM_001285389 NM_001285391 NM_001285392 NM_001285393 NM_004414
NM_203417 NM_203418 NM_001331016


NM_001081549 NM_019466

RefSeq (білок)

NP_001272318 NP_001272320 NP_001272321 NP_001272322 NP_001317945
NP_004405 NP_981962 NP_981963


NP_001075018 NP_062339

Локус (UCSC)

Хр. 21: 34.51 – 34.62 Mb

Хр. 16: 92.19 – 92.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RCAN1 (англ. Regulator of calcineurin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 252 амінокислот, а молекулярна маса — 28 079^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDGVAGPQL	GAAAEAAEAA	EARARPGVTL	RPFAPLSGAA	EADEGGGDWS
FIDCEMEEVD	LQDLPSATIA	CHLDPRVFVD	GLCRAKFESL	FRTYDKDITF
QYFKSFKRVR	INFSNPFSAA	DARLQLHKTE	FLGKEMKLYF	AQTLHIGSSH
LAPPNPDKQF	LISPPASPPV	GWKQVEDATP	VINYDLLYAI	SKLGPGEKYE
LHAATDTTPS	VVVHVCESDQ	EKEEEEEMER	MRRPKPKIIQ	TRRPEYTPIH
LS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

Fuentes J.-J., Pritchard M.A., Estivill X. (1997). Genomic organization, alternative splicing, and expression patterns of the DSCR1 (Down syndrome candidate region 1) gene. Genomics. 44: 358—361. PMID 9325060 DOI:10.1006/geno.1997.4866
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cho Y.J., Abe M., Kim S.Y., Sato Y. (2005). Raf-1 is a binding partner of DSCR1. Arch. Biochem. Biophys. 439: 121—128. PMID 15935327 DOI:10.1016/j.abb.2005.05.002

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3040 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P53805 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.