RAPGEF5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WGY

Ідентифікатори

Символи

RAPGEF5, GFR, MR-GEF, REPAC, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, MRGEF

Зовнішні ІД

OMIM: 609527 MGI: 2444365 HomoloGene: 56563 GeneCards: RAPGEF5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GTP-dependent protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• small GTPase mediated signal transduction • нейробіологія розвитку
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9771


217944

Ensembl


ENSG00000136237


ENSMUSG00000041992

UniProt


Q92565


Q8C0Q9

RefSeq (мРНК)


NM_012294 NM_001367600 NM_001367601 NM_001367602 NM_001367603


NM_175930 NM_001373989

RefSeq (білок)


NP_036426 NP_001354529 NP_001354530 NP_001354531 NP_001354532


NP_787126 NP_001360918

Локус (UCSC)

Хр. 7: 22.12 – 22.36 Mb

Хр. 12: 117.48 – 117.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAPGEF5 (англ. Rap guanine nucleotide exchange factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 67 733^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSSRLRVFD	PHLERKDSAA	ALSDRELPLP	TFDVPYFKYI	DEEDEDDEWS
SRSQSSTEDD	SVDSLLSDRY	VVVSGTPEKI	LEHLLNDLHL	EEVQDKETET
LLDDFLLTYT	VFMTTDDLCQ	ALLRHYSAKK	YQGKEENSDV	PRRKRKVLHL
VSQWIALYKD	WLPEDEHSKM	FLKTIYRNVL	DDVYEYPILE	KELKEFQKIL
GMHRRHTVDE	YSPQKKNKAL	FHQFSLKENW	LQHRGTVTET	EEIFCHVYIT
EHSYVSVKAK	VSSIAQEILK	VVAEKIQYAE	EDLALVAITF	SGEKHELQPN
DLVISKSLEA	SGRIYVYRKD	LADTLNPFAE	NEESQQRSMR	ILGMNTWDLA
LELMNFDWSL	FNSIHEQELI	YFTFSRQGSG	EHTANLSLLL	QRCNEVQLWV
ATEILLCSQL	GKRVQLVKKF	IKIAAHCKAQ	RNLNSFFAIV	MGLNTASVSR
LSQTWEKIPG	KFKKLFSELE	SLTDPSLNHK	AYRDAFKKMK	PPKIPFMPLL
LKDVTFIHEG	NKTFLDNLVN	FEKLHMIADT	VRTLRHCRTN	QFGDLSPKEH
QELKSYVNHL	YVIDSQQALF	ELSHRIEPRV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ichiba T., Hoshi Y., Eto Y., Tajima N., Kuraishi Y. (1999). Characterization of GFR, a novel guanine nucleotide exchange factor for Rap1. FEBS Lett. 457: 85—89. PMID 10486569 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01012-1
Rebhun J.F., Castro A.F., Quilliam L.A. (2000). Identification of guanine nucleotide exchange factors (GEFs) for the Rap1 GTPase. Regulation of MR-GEF by M-Ras-GTP interaction. J. Biol. Chem. 275: 34901—34908. PMID 10934204 DOI:10.1074/jbc.M005327200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16862 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92565 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.