PRX

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4CMZ

Ідентифікатори

Символи

PRX, CMT4F, periaxin

Зовнішні ІД

OMIM: 605725 MGI: 108176 HomoloGene: 76542 GeneCards: PRX

Пов'язані генетичні захворювання

Dejerine–Sottas disease^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• цитоплазма • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • T-tubule
Біологічний процес	• axon ensheathment • regulation of RNA splicing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57716


19153

Ensembl


ENSG00000105227


ENSMUSG00000053198

UniProt


Q9BXM0


O55103

RefSeq (мРНК)


NM_020956 NM_181882


NM_019412 NM_198048

RefSeq (білок)


NP_066007 NP_870998


NP_062285 NP_932165

Локус (UCSC)

Хр. 19: 40.39 – 40.41 Mb

Хр. 7: 27.2 – 27.22 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PRX (англ. Periaxin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 461 амінокислот, а молекулярна маса — 154 905^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEARSRSAEE	LRRAELVEII	VETEAQTGVS	GINVAGGGKE	GIFVRELRED
SPAARSLSLQ	EGDQLLSARV	FFENFKYEDA	LRLLQCAEPY	KVSFCLKRTV
PTGDLALRPG	TVSGYEIKGP	RAKVAKLNIQ	SLSPVKKKKM	VPGALGVPAD
LAPVDVEFSF	PKFSRLRRGL	KAEAVKGPVP	AAPARRRLQL	PRLRVREVAE
EAQAARLAAA	APPPRKAKVE	AEVAAGARFT	APQVELVGPR	LPGAEVGVPQ
VSAPKAAPSA	EAAGGFALHL	PTLGLGAPAP	PAVEAPAVGI	QVPQVELPAL
PSLPTLPTLP	CLETREGAVS	VVVPTLDVAA	PTVGVDLALP	GAEVEARGEA
PEVALKMPRL	SFPRFGARAK	EVAEAKVAKV	SPEARVKGPR	LRMPTFGLSL
LEPRPAAPEV	VESKLKLPTI	KMPSLGIGVS	GPEVKVPKGP	EVKLPKAPEV
KLPKVPEAAL	PEVRLPEVEL	PKVSEMKLPK	VPEMAVPEVR	LPEVELPKVS
EMKLPKVPEM	AVPEVRLPEV	QLLKVSEMKL	PKVPEMAVPE	VRLPEVQLPK
VSEMKLPEVS	EVAVPEVRLP	EVQLPKVPEM	KVPEMKLPKV	PEMKLPEMKL
PEVQLPKVPE	MAVPDVHLPE	VQLPKVPEMK	LPEMKLPEVK	LPKVPEMAVP
DVHLPEVQLP	KVPEMKLPKM	PEMAVPEVRL	PEVQLPKVSE	MKLPKVPEMA
VPDVHLPEVQ	LPKVCEMKVP	DMKLPEIKLP	KVPEMAVPDV	HLPEVQLPKV
SEIRLPEMQV	PKVPDVHLPK	APEVKLPRAP	EVQLKATKAE	QAEGMEFGFK
MPKMTMPKLG	RAESPSRGKP	GEAGAEVSGK	LVTLPCLQPE	VDGEAHVGVP
SLTLPSVELD	LPGALGLQGQ	VPAAKMGKGE	RVEGPEVAAG	VREVGFRVPS
VEIVTPQLPA	VEIEEGRLEM	IETKVKPSSK	FSLPKFGLSG	PKVAKAEAEG
AGRATKLKVS	KFAISLPKAR	VGAEAEAKGA	GEAGLLPALD	LSIPQLSLDA
HLPSGKVEVA	GADLKFKGPR	FALPKFGVRG	RDTEAAELVP	GVAELEGKGW
GWDGRVKMPK	LKMPSFGLAR	GKEAEVQGDR	ASPGEKAEST	AVQLKIPEVE
LVTLGAQEEG	RAEGAVAVSG	MQLSGLKVST	AGQVVTEGHD	AGLRMPPLGI
SLPQVELTGF	GEAGTPGQQA	QSTVPSAEGT	AGYRVQVPQV	TLSLPGAQVA
GGELLVGEGV	FKMPTVTVPQ	LELDVGLSRE	AQAGEAATGE	GGLRLKLPTL
GARARVGGEG	AEEQPPGAER	TFCLSLPDVE	LSPSGGNHAE	YQVAEGEGEA
GHKLKVRLPR	FGLVRAKEGA	EEGEKAKSPK	LRLPRVGFSQ	SEMVTGEGSP
SPEEEEEEEE	EGSGEGASGR	RGRVRVRLPR	VGLAAPSKAS	RGQEGDAAPK
SPVREKSPKF	RFPRVSLSPK	ARSGSGDQEE	GGLRVRLPSV	GFSETGAPGP
ARMEGAQAAA	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shi Y., Zhang L., Yang T. (2014). Nuclear export of L-periaxin, mediated by its nuclear export signal in the PDZ domain. PLoS ONE. 9: E91953—E91953. PMID 24633211 DOI:10.1371/journal.pone.0091953
Han H., Kursula P. (2014). Periaxin and AHNAK nucleoprotein 2 form intertwined homodimers through domain swapping. J. Biol. Chem. 289: 14121—14131. PMID 24675079 DOI:10.1074/jbc.M114.554816

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRX переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13797 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BXM0 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.