NTRK1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1HE7, 1SHC, 1WWA, 1WWW, 2IFG, 4AOJ, 4F0I, 4GT5, 4CRP, 4PMM, 4PMP, 4PMS, 4PMT, 4YNE, 4YPS

Ідентифікатори

Символи

NTRK1, MTC, TRK, TRK1, TRKA, Trk-A, p140-TrkA, neurotrophic receptor tyrosine kinase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 191315 MGI: 97383 HomoloGene: 1898 GeneCards: NTRK1

Реагує на сполуку

entrectinib, altiratinib, milciclib^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• neurotrophin binding • GPI-linked ephrin receptor activity • neurotrophin receptor activity • kinase activity • ATP binding • protein kinase activity • kinase binding • transferase activity • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleotide binding • nerve growth factor binding • neurotrophin p75 receptor binding • protein tyrosine kinase activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • nerve growth factor receptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ендосома • мембрана • late endosome membrane • cell surface • integral component of membrane • late endosome • early endosome membrane • receptor complex • клітинна мембрана • аксон • neuronal cell body • early endosome • integral component of plasma membrane • дендрит (нейробіологія) • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • Golgi membrane • endosome membrane • GO:0009327 protein-containing complex • recycling endosome • recycling endosome membrane
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of Ras protein signal transduction • positive regulation of programmed cell death • behavioral response to formalin induced pain • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain • protein phosphorylation • циркадний ритм • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • B cell differentiation • response to ethanol • іннервація • negative regulation of cell population proliferation • response to nicotine • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic • response to nutrient levels • learning or memory • protein autophosphorylation • negative regulation of neuron death • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain • диференціація клітин • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • фосфорилювання • cellular response to nicotine • olfactory nerve development • response to electrical stimulus • Sertoli cell development • mechanoreceptor differentiation • нейробіологія розвитку • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • response to axon injury • sensory perception of pain • response to radiation • phosphatidylinositol-mediated signaling • sympathetic nervous system development • ephrin receptor signaling pathway • cellular response to growth factor stimulus • GO:0010260 старіння людини • response to hydrostatic pressure • response to activity • axon guidance • multicellular organism development • axonogenesis involved in innervation • positive regulation of neuron projection development • programmed cell death involved in cell development • positive regulation of synapse assembly • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • microtubule-based movement • peptidyl-tyrosine phosphorylation • peptidyl-tyrosine autophosphorylation • nerve growth factor signaling pathway • cellular response to nerve growth factor stimulus • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • negative regulation of apoptotic process • regulation of MAPK cascade • positive regulation of MAPK cascade • cellular response to amyloid-beta
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4914


18211

Ensembl


ENSG00000198400


ENSMUSG00000028072

UniProt


P04629


Q3UFB7

RefSeq (мРНК)


NM_002529 NM_001007792 NM_001012331


NM_001033124

RefSeq (білок)


NP_001007793 NP_001012331 NP_002520


NP_001028296

Локус (UCSC)

Хр. 1: 156.82 – 156.88 Mb

Хр. 3: 87.69 – 87.7 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NTRK1 (англ. Neurotrophic receptor tyrosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 87 497^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLRGGRRGQL	GWHSWAAGPG	SLLAWLILAS	AGAAPCPDAC	CPHGSSGLRC
TRDGALDSLH	HLPGAENLTE	LYIENQQHLQ	HLELRDLRGL	GELRNLTIVK
SGLRFVAPDA	FHFTPRLSRL	NLSFNALESL	SWKTVQGLSL	QELVLSGNPL
HCSCALRWLQ	RWEEEGLGGV	PEQKLQCHGQ	GPLAHMPNAS	CGVPTLKVQV
PNASVDVGDD	VLLRCQVEGR	GLEQAGWILT	ELEQSATVMK	SGGLPSLGLT
LANVTSDLNR	KNVTCWAEND	VGRAEVSVQV	NVSFPASVQL	HTAVEMHHWC
IPFSVDGQPA	PSLRWLFNGS	VLNETSFIFT	EFLEPAANET	VRHGCLRLNQ
PTHVNNGNYT	LLAANPFGQA	SASIMAAFMD	NPFEFNPEDP	IPVSFSPVDT
NSTSGDPVEK	KDETPFGVSV	AVGLAVFACL	FLSTLLLVLN	KCGRRNKFGI
NRPAVLAPED	GLAMSLHFMT	LGGSSLSPTE	GKGSGLQGHI	IENPQYFSDA
CVHHIKRRDI	VLKWELGEGA	FGKVFLAECH	NLLPEQDKML	VAVKALKEAS
ESARQDFQRE	AELLTMLQHQ	HIVRFFGVCT	EGRPLLMVFE	YMRHGDLNRF
LRSHGPDAKL	LAGGEDVAPG	PLGLGQLLAV	ASQVAAGMVY	LAGLHFVHRD
LATRNCLVGQ	GLVVKIGDFG	MSRDIYSTDY	YRVGGRTMLP	IRWMPPESIL
YRKFTTESDV	WSFGVVLWEI	FTYGKQPWYQ	LSNTEAIDCI	TQGRELERPR
ACPPEVYAIM	RGCWQREPQQ	RHSIKDVHAR	LQALAQAPPV	YLDVLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

Martin-Zanca D., Oskam R., Mitra G., Copeland T.D., Barbacid M. (1989). Molecular and biochemical characterization of the human trk proto-oncogene. Mol. Cell. Biol. 9: 24—33. PMID 2927393 DOI:10.1128/MCB.9.1.24
Indo Y., Mardy S., Tsuruta M., Karim M.A., Matsuda I. (1997). Structure and organization of the human TRKA gene encoding a high affinity receptor for nerve growth factor. Jpn. J. Hum. Genet. 42: 343—351. PMID 9290260 DOI:10.1007/BF02766957
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fujimoto M., Kitazawa R., Maeda S., Kitazawa S. (2005). Methylation adjacent to negatively regulating AP-1 site reactivates TrkA gene expression during cancer progression. Oncogene. 24: 5108—5118. PMID 15870692 DOI:10.1038/sj.onc.1208697
Martin-Zanca D., Hughes S.H., Barbacid M. (1986). A human oncogene formed by the fusion of truncated tropomyosin and protein tyrosine kinase sequences. Nature. 319: 743—748. PMID 2869410 DOI:10.1038/319743a0
Hempstead B.L., Martin-Zanca D., Kaplan D.R., Parada L.F., Chao M.V. (1991). High-affinity NGF binding requires coexpression of the trk proto-oncogene and the low-affinity NGF receptor. Nature. 350: 678—683. PMID 1850821 DOI:10.1038/350678a0

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Neurotrophic receptor tyrosine kinase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8031 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P04629 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.