HLA-F

HLA-F
Ідентифікатори
Символи HLA-F, CDA12, HLA-5.4, HLA-CDA12, major histocompatibility complex, class I, F
Зовнішні ІД OMIM: 143110 MGI: 3647514 HomoloGene: 133121 GeneCards: HLA-F
Онтологія гена
Молекулярна функція

• TAP2 binding
• TAP1 binding
• signaling receptor binding
• peptide antigen binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• beta-2-microglobulin binding
• 14-3-3 protein binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• phagocytic vesicle membrane
• early endosome membrane
• мембрана
• Golgi membrane
• клітинна мембрана
• cell surface
• ендоплазматичний ретикулум
• MHC class I protein complex
• ER to Golgi transport vesicle membrane
• integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane
• recycling endosome membrane
• міжклітинний простір
• лізосома
• lysosomal membrane
• ендосома
• external side of plasma membrane
• MHC class Ib protein complex

Біологічний процес

• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent
• interferon-gamma-mediated signaling pathway
• процес імунної системи
• antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent
• type I interferon signaling pathway
• regulation of immune response
• positive regulation of T cell mediated cytotoxicity
• antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class Ib
• antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I via ER pathway, TAP-independent
• negative regulation of T cell cytokine production
• negative regulation of natural killer cell cytokine production
• positive regulation of natural killer cell cytokine production
• negative regulation of natural killer cell degranulation
• positive regulation of natural killer cell degranulation
• negative regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity
• negative regulation of neuron death

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3134
630294
Ensembl
ENSG00000229698
ENSG00000237508
ENSG00000234487
ENSG00000206509
ENSG00000137403
ENSG00000235220
ENSG00000204642
н/д
UniProt
P30511
Q0WXH6
RefSeq (мРНК)
NM_001098478
NM_001098479
NM_018950
NM_001177467
RefSeq (білок)
NP_001091948
NP_001091949
NP_061823
NP_001170938
Локус (UCSC) Хр. 6: 29.72 – 29.74 Mb н/д
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HLA-F (англ. Major histocompatibility complex, class I, F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 39 062[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAPRSLLLLLSGALALTDTWAGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRYIAVEYVD
DTQFLRFDSDAAIPRMEPREPWVEQEGPQYWEWTTGYAKANAQTDRVALR
NLLRRYNQSEAGSHTLQGMNGCDMGPDGRLLRGYHQHAYDGKDYISLNED
LRSWTAADTVAQITQRFYEAEEYAEEFRTYLEGECLELLRRYLENGKETL
QRADPPKAHVAHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEEQTQDTE
LVETRPAGDGTFQKWAAVVVPPGEEQRYTCHVQHEGLPQPLILRWEQSPQ
PTIPIVGIVAGLVVLGAVVTGAVVAAVMWRKKSSDRNRGSYSQAAV

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

  • Geraghty D.E., Wei X., Orr H.T., Koller B.H. (1990). Human leukocyte antigen F (HLA-F). An expressed HLA gene composed of a class I coding sequence linked to a novel transcribed repetitive element. J. Exp. Med. 171: 1—18. PMID 1688605 DOI:10.1084/jem.171.1.1
  • Lury D., Epstein H., Holmes N. (1990). The human class I MHC gene HLA-F is expressed in lymphocytes. Int. Immunol. 2: 531—537. PMID 1707659 DOI:10.1093/intimm/2.6.531
  • He X., Xu L., Liu Y., Zeng Y. (2004). Identification of a novel HLA-F allele - HLA-F*010102. Tissue Antigens. 63: 181—183. PMID 14705989 DOI:10.1111/j.1399-0039.2004.00145.x
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4963 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P30511 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.