TRAIL

Faktor nekroze tumora (ligand) superfamilija, član 10
PDB prikaz baziran na 1d0g​.
Dostupne strukture
1d0g​, 1d2q​, 1d4v​, 1dg6​, 1du3
Identifikatori
Simboli TNFSF10; APO2L; Apo-2L; CD253; TL2; TRAIL
Vanjski ID OMIM: 603598 MGI: 107414 HomoloGene: 2824 GeneCards: TNFSF10 Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost prenosa signala
citokinska aktivnost
vezivanje za faktor nekroze tumora
vezivanje jona cinka
vezivanje metalnih jona
Celularna komponenta ekstracelularni prostor
rastvorna frakcija
integralno sa membranom plazme
membrana
Biološki proces apoptoza
indukcija apoptoze
imunski odgovor
prenos signala
interćelijska signalizacija
pozitivna regulacija I-kapaB kinaze/NF-kapaB kaskade
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
Vrsta Čovek Miš
Entrez 8743 22035
Ensembl ENSG00000121858 ENSMUSG00000039304
UniProt P50591 Q3TZR6
RefSeq (mRNA) NM_003810 NM_009425
RefSeq (protein) NP_003801 NP_033451
Lokacija (UCSC) Chr 3:
173.71 - 173.72 Mb
Chr 3:
27.51 - 27.53 Mb
PubMed pretraga [1] [2]

TRAIL, TNF-srodni apoptoza-indukujući ligand, je protein koji funkcioniše kao ligand koji indukuje proces ćelijske smrti (apoptozu). TRAIL je takođe naziva CD253 (klaster diferencijacije 253).[1][2][3]

Gen

Kod ljudi, gen koji kodira TRAIL je lociran na hromozomu 3q26. On nije u blizini drugih članova TNF familije. Genomska struktura TRAIL gena se sastoji od približno 20 kb i formirana je od pet eksonskih segmenata 222, 138, 42, 106, i 1245 nukleotida i četiri introna sa približno 8.2, 3.2, 2.3 i 2.3 kb. TRAIL genu nedostaju TATA i CAAT kutije, i promotorski region sadrži putativne response elemente za GATA, AP-1, C/EBP, SP-1, OCT-1, AP3, PEA3, CF-1, i ISRE.

Struktura

TRAIL pokazuje homologiju sa drugim članovima faktor nekroze tumora superfamilije. On se sastoji od 281 aminokiseline i ima karakteristike tipa II transmembranskog proteina (i.e. nema vodeću sekvencu i unutrašnji transmembranski domen). N-terminalni citoplazmatični domen nije konzerviran među članovima familije. U kontrastu s njim, C-terminalni ekstracelularni domen je konzerviran i može biti proteolitički odsečen sa ćelijske površine. TRAIL formira homotrimer koji vezuje tri molekula receptora.

Funkcija

TRAIL se vezuje za receptore smrti DR4 (TRAIL-RI) i DR5 (TRAIL-RII). Proces apoptoze je zavistan od kaspaze-8. Kaspaza-8 aktivira nizvodne efektorske kaspaze uključujući prokaspaze-3, -6, i -7, što dovodi do aktivacije specifičnih kinaza.[4] TRAIL se takođe vezuje za receptore DcR1 i DcR2, koji ne sadrže citoplazmatični domen (DcR1), ili koji imaju skraćeni domen smrti (DcR2). DcR1 funkcioniše kao TRAIL-neutrališući mamac-receptor. Citoplazmatični DcR2 domen je funkcionalan i aktivira NFkapaB. U ćelijama koje izražavaju DcR2, TRAIL vezivanje aktivira NFkapaB, što dovodi do transkripcije gena za koje se zna da antagoniziraju signalni put smrti i/ili da promovišu inflamaciju.

Interakcije

Za TRAIL je bilo pokazano da interaguje sa TNFRSF10B.[5][6][7]

Vidi još

  • Mapa proteolize

Reference

  1. ^ Wiley SR, Schooley K, Smolak PJ, Din WS, Huang CP, Nicholl JK, Sutherland GR, Smith TD, Rauch C, Smith CA (1995). „Identification and characterization of a new member of the TNF family that induces apoptosis”. Immunity. 3 (6): 673—82. PMID 8777713. doi:10.1016/1074-7613(95)90057-8. 
  2. ^ Pitti RM, Marsters SA, Ruppert S, Donahue CJ, Moore A, Ashkenazi A (1996). „Induction of apoptosis by Apo-2 ligand, a new member of the tumor necrosis factor cytokine family”. J. Biol. Chem. 271 (22): 12687—90. PMID 8663110. doi:10.1074/jbc.271.22.12687. Архивирано из оригинала 19. 01. 2005. г. Приступљено 04. 08. 2010. 
  3. ^ Mire-Sluis, Anthony R.; Thorpe, Robin, ур. (1998). Cytokines (Handbook of Immunopharmacology). Boston: Academic Press. ISBN 0-12-498340-5. 
  4. ^ Song JJ, Lee YJ (2008). „Differential cleavage of Mst1 by caspase-7/-3 is responsible for TRAIL-induced activation of the MAPK superfamily”. Cell. Signal. 20 (5): 892—906. PMC 2483832 Слободан приступ. PMID 18276109. doi:10.1016/j.cellsig.2008.01.001. 
  5. ^ Kaptein, A; M, Jansen; et al. (2000). „Studies on the interaction between TWEAK and the death receptor WSL-1/TRAMP (DR3)”. FEBS Lett. NETHERLANDS. 485 (2-3): 135—41. ISSN 0014-5793. PMID 11094155. doi:10.1016/S0014-5793(00)02219-5. 
  6. ^ Walczak, H; Degli-Esposti M A; et al. (1997). „TRAIL-R2: a novel apoptosis-mediating receptor for TRAIL”. EMBO J. ENGLAND. 16 (17): 5386—97. ISSN 0261-4189. PMC 1170170 Слободан приступ. PMID 9311998. doi:10.1093/emboj/16.17.5386. 
  7. ^ Hymowitz, S G; Christinger H W; et al. (1999). „Triggering cell death: the crystal structure of Apo2L/TRAIL in a complex with death receptor 5”. Mol. Cell. UNITED STATES. 4 (4): 563—71. ISSN 1097-2765. PMID 10549288. doi:10.1016/S1097-2765(00)80207-5. 

Literatura

  • Wiley S, Schooley K, Smolak P, Din W, Huang C, Nicholl J, Sutherland G, Smith T, Rauch C, Smith C (1995). „Identification and characterization of a new member of the TNF family that induces apoptosis”. Immunity. 3 (6): 673—82. PMID 8777713. doi:10.1016/1074-7613(95)90057-8. 
  • Almasan A, Ashkenazi A (2004). „Apo2L/TRAIL: apoptosis signaling, biology, and potential for cancer therapy.”. Cytokine Growth Factor Rev. 14 (3-4): 337—48. PMID 12787570. doi:10.1016/S1359-6101(03)00029-7. 
  • Cha SS, Song YL, Oh BH (2004). „Specificity of molecular recognition learned from the crystal structures of TRAIL and the TRAIL:sDR5 complex.”. Vitam. Horm. 67: 1—17. PMID 15110168. doi:10.1016/S0083-6729(04)67001-4. 
  • Song C, Jin B (2005). „TRAIL (CD253), a new member of the TNF superfamily.”. J. Biol. Regul. Homeost. Agents. 19 (1-2): 73—7. PMID 16178278. 
  • Bucur O, Ray S, Bucur MC, Almasan A (2006). „APO2 ligand/tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand in prostate cancer therapy.”. Front. Biosci. 11: 1549—68. PMID 16368536. doi:10.2741/1903. 

Spoljašnje veze

  • Apoptoza, Trail & Kaspaze 8 - Mapa proteolize-animacija
  • PDB: 1D2Q
  • TRAIL+Protein на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
  • п
  • р
  • у
PDB Galerija
  • п
  • р
  • у
Po familiji
Interleukin
  • IL-1 superfamilija
  • 1 (1Ra)
  • 18
  • 33
  • poput IL-6/gp130 koristeći
    IL-10 familija
    Interferon tip III
    Zajednički γ-lanac familija
    IL-12 familija
    Drugi
    Hemokini
    CCL
    CXCL
    CX3CL
    XCL
    TNF
    Glavni
    TNF (ligand) superfamilija
    Klaster diferencijacije
    Interferon
    I
    II
    III
    Drugi
    Po funkciji
    • п
    • р
    • у
    1-50
    CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) • CD2 • CD3 (γ, δ, ε) • CD4 • CD5 • CD6 • CD7 • CD8 (a) • CD9 • CD10 • CD11 (a, b, c) • CD13 • CD14 • CD15 • CD16 (A, B) • CD18 • CD19 • CD20 • CD21 • CD22 • CD23 • CD24 • CD25 • CD26 • CD27 • CD28 • CD29 • CD30 • CD31 • CD32 (A, B) • CD33 • CD34 • CD35 • CD36 • CD37 • CD38 • CD39 • CD40 • CD41 • CD42 (a, b, c, d) • CD43 • CD44 • CD45 • CD46 • CD47 • CD48 • CD49 (a, b, c, d, e, f) • CD50
    51-100
    CD51 • CD52 • CD53 • CD54 • CD55 • CD56 • CD57 • CD58 • CD59 • CD61 • CD62 (E, L, P) • CD63 • CD64 (A, B, C) • CD66 (a, b, c, d, e, f) • CD68 • CD69 • CD70 • CD71 • CD72 • CD73 • CD74 • CD78 • CD79 (a, b) • CD80 • CD81 • CD82 • CD83 • CD84 • CD85 (a, d, e, h, j, k) • CD86 • CD87 • CD88 • CD89 • CD90 • CD91- CD92 • CD93 • CD94 • CD95 • CD96 • CD97 • CD98 • CD99 • CD100
    101-150
    CD101 • CD102 • CD103 • CD104 • CD105 • CD106 • CD107 (a, b) • CD108 • CD109 • CD110 • CD111 • CD112 • CD113 • CD114 • CD115 • CD116 • CD117 • CD118 • CD119 • CD120 (a, b) • CD121 (a, b) • CD122 • CD123 • CD124 • CD125 • CD126 • CD127 • CD129 • CD130 • CD131 • CD132 • CD133 • CD134 • CD135 • CD136 • CD137 • CD138 • CD140b • CD141 • CD142 • CD143 • CD144 • CD146 • CD147 • CD148 • CD150
    151-200
    CD151 • CD152 • CD153 • CD154 • CD155 • CD156 (a, b, c) • CD157 • CD158 (a, d, e, i, k) • CD159 (a, c) • CD160 • CD161 • CD162 • CD163 • CD164 • CD166 • CD167 (a, b) • CD168 • CD169 • CD170 • CD171 • CD172 (a, b, g) • CD174 • CD177 • CD178 • CD179 (a, b) • CD181 • CD182 • CD183 • CD184 • CD185 • CD186 • CD191 • CD192 • CD193 • CD194 • CD195 • CD196 • CD197 • CDw198 • CDw199 • CD200
    201-250
    CD201 • CD202b • CD204 • CD205 • CD206 • CD207 • CD208 • CD209 • CDw210 (a, b) • CD212 • CD213a (1, 2) • CD217 • CD218 (a, b) • CD220 • CD221 • CD222 • CD223 • CD224 • CD225 • CD226 • CD227 • CD228 • CD229 • CD230 • CD233 • CD234 • CD235 (a, b) • CD236 • CD238 • CD239 • CD240CE • CD241 • CD243 • CD244 • CD246 • CD247- CD248 • CD249
    251-300
    CD252 • CD253 • CD254 • CD256 • CD257 • CD258 • CD261 • CD262 • CD264 • CD265 • CD266 • CD267 • CD268 • CD269 • CD271 • CD272 • CD273 • CD274 • CD275 • CD276 • CD278 • CD279 • CD280 • CD281 • CD282 • CD283 • CD284 • CD286 • CD288 • CD289 • CD290 • CD292 • CDw293 • CD294 • CD295 • CD297 • CD298 • CD299
    301-350
    CD300A • CD301 • CD302 • CD303 • CD304 • CD305 • CD306 • CD307 • CD309 • CD312 • CD314 • CD315 • CD316 • CD317 • CD318 • CD320 • CD321 • CD322 • CD324 • CD325 • CD326 • CD328 • CD329 • CD331 • CD332 • CD333 • CD334 • CD335 • CD336 • CD337 • CD338 • CD339 • CD340 • CD344 • CD349 • CD350