シュードモナス属

シュードモナス属
タイプ種である緑膿菌(P. aeruginosa)の電子顕微鏡写真
分類
ドメイン : 真正細菌
Bacteria
: Pseudomonadota
: ガンマプロテオバクテリア綱
Gammaproteobacteria
: シュードモナス目
Pseudomonadales
: シュードモナス科
Pseudomonadaceae
: シュードモナス属
Pseudomonas
学名
Pseudomonas
Migula 1894[1]
(IJSEMリストに掲載 1980)[2]
タイプ種
緑膿菌
Pseudomonas aeruginosa

(Schroeter 1872)[3]
Migula 1900[4]
(IJSEMリストに掲載 1980)[2]
シノニム
  • "Geopseudomonas"
    Rudra and Gupta 2024
  • "Metapseudomonas"
    Rudra and Gupta 2024
  • "Ectopseudomonas"
    Rudra and Gupta 2024
  • "Aquipseudomonas"
    Rudra and Gupta 2024
  • "Caenipseudomonas"
    Rudra and Gupta 2024
  • "Phytopseudomonas"
    Rudra and Gupta 2024
  • "Zestomonas"
    Rudra and Gupta 2024
  • Stutzerimonas
    Lalucat et al. 2022
  • フラビモナス属
    Flavimonas
    Holmes et al. 1987
  • サーペンス属
    Serpens
    Hespell 1977
    (Approved Lists 1980)
下位分類(種)(2024年6月現在)[5]
  • シュードモナス・アビエタニフィラ
    Pseudomonas abietaniphila
    Mohn et al. 1999
  • Pseudomonas abyssi
    Wei et al. 2018
  • Pseudomonas aegrilactucae
    Sawada et al. 2022
  • シュードモナス・エルジノーサ
    (シュードモナス・アエルギノサ)
    Pseudomonas aeruginosa
    (Schroeter 1872)[3]
    Migula 1900[4]
    (IJSEMリストに掲載 1980)[2]
  • Pseudomonas aestuarii
    Kim et al. 2023
  • シュードモナス・アガリシ
    (シュードモナス・アガリキ)
    Pseudomonas agarici
    Young 1970
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas akappageensis
    corrig. Morimoto et al. 2020
  • シュードモナス・アルカリゲネス
    Pseudomonas alcaligenes
    Monias 1928
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・アルカリフィラ
    Pseudomonas alcaliphila
    Yumoto et al. 2001
  • Pseudomonas alkylphenolica
    Mulet et al. 2015
  • Pseudomonas allii
    Sawada et al. 2021
  • Pseudomonas alliivorans
    Zhao et al. 2022
  • Pseudomonas allokribbensis
    Morimoto et al. 2021
  • Pseudomonas alloputida
    Keshavarz-Tohid et al. 2020
  • Pseudomonas alvandae
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・アミグダリ
    Pseudomonas amygdali
    Psallidas and Panagopoulos 1975
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas anatoliensis
    Duman et al. 2021
  • シュードモナス・アンギリセプチカ
    Pseudomonas anguilliseptica
    Wakabayashi and Egusa 1972
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・アンタルクティカ
    Pseudomonas antarctica
    Reddy et al. 2004
  • Pseudomonas anuradhapurensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas aphyarum
    Testerman et al. 2023
  • Pseudomonas arcuscaelestis
    Mulet et al. 2021
  • シュードモナス・アルゼンチネンシス
    Pseudomonas argentinensis
    Peix et al. 2005
  • Pseudomonas aromaticivorans
    Banerjee et al. 2023
  • シュードモナス・アルセニコキシダンス
    Pseudomonas arsenicoxydans
    Campos et al. 2011
  • Pseudomonas asgharzadehiana
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas asiatica
    Tohya et al. 2019
  • シュードモナス・アスプレニイ
    Pseudomonas asplenii
    (Ark and Tompkins 1946)
    Savulescu 1947
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas asturiensis
    González et al. 2013
  • Pseudomonas atacamensis
    Poblete-Morales et al. 2021
  • Pseudomonas atagonensis
    corrig. Morimoto et al. 2020
  • シュードモナス・アベルラナエ
    Pseudomonas avellanae
    Janse et al. 1997
  • Pseudomonas aylmerensis
    corrig. Tchagang et al. 2021
  • Pseudomonas azadiae
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas azerbaijanoccidentalis
    corrig. Girard et al. 2022
  • Pseudomonas azerbaijanorientalis
    corrig. Girard et al. 2022
  • シュードモナス・アゾティフィゲンス
    Pseudomonas azotifigens
    Hatayama et al. 2005
  • シュードモナス・アゾトフォルマンス
    Pseudomonas azotoformans
    Iizuka and Komagata 1963
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・バエティカ
    Pseudomonas baetica
    López et al. 2012
  • シュードモナス・バレアリカ
    Pseudomonas balearica
    Bennasar et al. 1996
  • Pseudomonas baltica
    Gieschler et al. 2021
  • Pseudomonas bananamidigenes
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・ベンゼニヴォランス
    Pseudomonas benzenivorans
    Lang et al. 2012
  • Pseudomonas benzopyrenica
    Dong et al. 2023
  • シュードモナス・ベテリ
    Pseudomonas beteli
    corrig. (Ragunathan 1928)
    Savulescu 1947
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas bijieensis
    Liang et al. 2021
  • Pseudomonas boanensis
    Nicklasson et al. 2022
  • Pseudomonas bohemica
    Saati-Santamaría et al. 2018
  • シュードモナス・ボルボリ
    Pseudomonas borbori
    Vanparys et al. 2006
  • シュードモナス・ボレオポリス
    Pseudomonas boreopolis
    Gray and Thornton 1928
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas botevensis
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・ブラッシカセアルム
    Pseudomonas brassicacearum
    Achouak et al. 2000
    • シュードモナス・ブラッシカケアルム亜種ブラッシカケアルム
      Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum
      (Achouak et al. 2000)
      Ivanova et al. 2009
    • シュードモナス・ブラッシカケアルム亜種ネオアウランティアカ
      Pseudomonas brassicacearum subsp. neoaurantiaca
      Ivanova et al. 2009
  • Pseudomonas brassicae
    Sawada et al. 2020
  • シュードモナス・ブレンネリ
    Pseudomonas brenneri
    Baïda et al. 2002
  • Pseudomonas bubulae
    Lick et al. 2020
  • Pseudomonas californiensis
    Carvalho et al. 2022
  • Pseudomonas campi
    Timsy et al. 2021
  • Pseudomonas canadensis
    Tambong et al. 2017
  • Pseudomonas canavaninivorans
    Hauth et al. 2022
  • シュードモナス・カンナビナ
    Pseudomonas cannabina
    (ex Šutič and Dowson 1959)
    Gardan et al. 1999
  • Pseudomonas capsici
    Zhao et al. 2021
  • Pseudomonas carbonaria
    Kämpfer et al. 2021
  • シュードモナス・カーボキシドハイドロゲナ
    (シュードモナス・カルボキシドヒドロゲナ)
    Pseudomonas carboxydohydrogena
    (ex Sanjieva and Zavarzin 1971)
    Meyer et al. 1980
  • シュードモナス・カリカパパヤエ
    Pseudomonas caricapapayae
    Robbs 1956
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas carnis
    Lick et al. 2020
  • Pseudomonas caspiana
    Busquets et al. 2017
  • Pseudomonas cavernae
    Zhu et al. 2022
  • Pseudomonas cavernicola
    Zhu et al. 2022
  • シュードモナス・セドリナ
    (シュードモナス・ケドリナ)
    Pseudomonas cedrina
    corrig. Dabboussi et al. 2002
    • シュードモナス・セドリナ亜種セドリナ
      Pseudomonas cedrina subsp. cedrina
      (Dabboussi et al. 2002)
      Behrendt et al. 2009
    • シュードモナス・セドリナ亜種フルギダ
      Pseudomonas cedrina subsp. fulgida
      Behrendt et al. 2009
  • Pseudomonas cerasi
    Kałuzna et al. 2017
  • Pseudomonas chengduensis
    Tao et al. 2014
  • シュードモナス・クロロラフィス
    Pseudomonas chlororaphis
    (Guignard and Sauvageau 1894) Bergey et al. 1930
    (Approved Lists 1980)
    • シュードモナス・クロロラフィス亜種アウランティアカ
      Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantiaca
      (Nakhimovskaya 1948) Peix et al. 2007
    • シュードモナス・クロロラフィス亜種アウレオファキエンス
      Pseudomonas chlororaphis subsp. aureofaciens
      (Kluyver 1956)
      Peix et al. 2007
    • シュードモナス・クロロラフィス亜種クロロラフィス
      Pseudomonas chlororaphis subsp. chlororaphis
      (Guignard and Sauvageau 1894) Peix et al. 2007
    • シュードモナス・クロロラフィス亜種ピスキウム
      Pseudomonas chlororaphis subsp. piscium
      Burr et al. 2010
  • シュードモナス・シクホリイ
    (シュードモナス・キコリイ)
    Pseudomonas cichorii
    (Swingle 1925)
    Stapp 1928
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas citri
    Gao et al. 2023
  • シュードモナス・シトロネロリス
    Pseudomonas citronellolis
    Seubert 1960
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas coleopterorum
    Menéndez et al. 2015
  • シュードモナス・コンポスティ
    Pseudomonas composti
    Gibello et al. 2011
  • シュードモナス・コンゲランス
    Pseudomonas congelans
    Behrendt et al. 2003
  • シュードモナス・コルルガタ
    Pseudomonas corrugata
    Roberts and Scarlett 1981
  • シュードモナス・コスタンチニイ
    Pseudomonas costantinii
    Munsch et al. 2002
  • シュードモナス・クレモリコロラタ
    Pseudomonas cremoricolorata
    Uchino et al. 2002
  • Pseudomonas cremoris
    Hofmann et al. 2021
  • Pseudomonas crudilactis
    Schlusselhuber et al. 2022
  • シュードモナス・クアトロキエネガセンシス
    Pseudomonas cuatrocienegasensis
    Escalante et al. 2009
  • Pseudomonas cucumis
    Liao et al. 2023
  • Pseudomonas cyclaminis
    Sawada et al. 2021
  • Pseudomonas danubii
    Mulet et al. 2023
  • Pseudomonas daroniae
    Bueno-Gonzalez et al. 2019
  • シュードモナス・デケプティオネンシス
    Pseudomonas deceptionensis
    Carrión et al. 2011
  • Pseudomonas defluvii
    Qin et al. 2020
  • シュードモナス・デルヒエンシス
    Pseudomonas delhiensis
    Prakash et al. 2007
  • Pseudomonas donghuensis
    Gao et al. 2015
  • Pseudomonas dryadis
    Bueno-Gonzalez et al. 2019
  • Pseudomonas edaphica
    Ramírez-Bahena et al. 2019
  • Pseudomonas ekonensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas endophytica
    Ramírez-Bahena et al. 2015
  • シュードモナス・エントモフィラ
    Pseudomonas entomophila
    Mulet et al. 2012
  • シュードモナス・エクストレマウストラリス
    Pseudomonas extremaustralis
    López et al. 2010
  • シュードモナス・イクストレモリエンタリス
    Pseudomonas extremorientalis
    Ivanova et al. 2002
  • Pseudomonas fakonensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas farris
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas farsensis
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・フィクセレクタエ
    Pseudomonas ficuserectae
    Goto 1983
  • Pseudomonas fildesensis
    Pavlov et al. 2020
  • Pseudomonas fitomaticsae
    Atanasov et al. 2022
  • シュードモナス・フラベッセンス
    Pseudomonas flavescens
    Hildebrand et al. 1994
  • Pseudomonas flexibilis
    (Hespell 1977)
    Shin et al. 2016
  • Pseudomonas floridensis
    Timilsina et al. 2018
  • Pseudomonas fluorescens
    Migula 1895
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas fluvialis
    Sudan et al. 2018
  • Pseudomonas folii
    Tambong et al. 2022
  • Pseudomonas fontis
    Testerman et al. 2023
  • シュードモナス・フラギ
    Pseudomonas fragi
    (Eichholz 1902)
    Gruber 1905
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・フレデリクスベーゲンシス
    Pseudomonas frederiksbergensis
    Andersen et al. 2000
  • シュードモナス・フルヴァ
    Pseudomonas fulva
    Iizuka and Komagata 1963
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas furukawaii
    Kimura et al. 2018
  • シュードモナス・ゲリディコーラ
    Pseudomonas gelidicola
    Kadota 1951
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas germanica
    Atanasov et al. 2022
  • シュードモナス・ゲッサーディイ
    (シュードモナス・ゲッサルディイ)
    Pseudomonas gessardii
    Verhille et al. 1999
  • Pseudomonas glareae
    Romanenko et al. 2015
  • Pseudomonas glycinae
    Jia et al. 2021
  • Pseudomonas gozinkensis
    Morimoto et al. 2021
  • シュードモナス・グラミニス
    Pseudomonas graminis
    Behrendt et al. 1999
  • Pseudomonas granadensis
    Pascual et al. 2015
  • Pseudomonas gregormendelii
    Kosina et al. 2022
  • シュードモナス・グリモンティイ
    Pseudomonas grimontii
    Baïda et al. 2002
  • Pseudomonas guangdongensis
    Yang et al. 2013
  • Pseudomonas guariconensis
    Toro et al. 2013
  • Pseudomonas guguanensis
    Liu et al. 2013
  • シュードモナス・グイネアエ
    Pseudomonas guineae
    Bozal et al. 2007
  • Pseudomonas guryensis
    Kim et al. 2021
  • Pseudomonas haemolytica
    Hofmann et al. 2020
  • Pseudomonas hamedanensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas hefeiensis
    Liao et al. 2024
  • Pseudomonas helleri
    von Neubeck et al. 2016
  • Pseudomonas helmanticensis
    Ramírez-Bahena et al. 2014
  • シュードモナス・ヒビシコーラ
    (シュードモナス・ヒビシコラ)
    Pseudomonas hibiscicola
    Moniz 1963 (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas hormoni
    Sorty et al. 2023
  • Pseudomonas huaxiensis
    Qin et al. 2019
  • Pseudomonas hydrolytica
    Zhou et al. 2020
  • Pseudomonas idahonensis
    Testerman et al. 2023
  • シュードモナス・インディカ
    Pseudomonas indica
    Pandey et al. 2002
  • Pseudomonas inefficax
    Keshavarz-Tohid et al. 2019
  • Pseudomonas insulae
    Lee et al. 2022
  • Pseudomonas iranensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas iridis
    Duman et al. 2021
  • Pseudomonas izuensis
    Lu et al. 2020
  • シュードモナス・ジャポニカ
    Pseudomonas japonica
    Pungrasmi et al. 2008
  • シュードモナス・ジェッセニイ
    Pseudomonas jessenii
    Verhille et al. 1999
  • シュードモナス・ジンジュエンシス
    Pseudomonas jinjuensis
    Kwon et al. 2003
  • Pseudomonas juntendi
    Tohya et al. 2019
  • Pseudomonas kairouanensis
    Oueslati et al. 2020
  • Pseudomonas karstica
    Švec et al. 2020
  • Pseudomonas kermanshahensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas khavaziana
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas khazarica
    Tarhriz et al. 2020
  • Pseudomonas khorasanensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas kielensis
    Gieschler et al. 2021
  • シュードモナス・キロネンシス
    Pseudomonas kilonensis
    Sikorski et al. 2001
  • Pseudomonas kirkiae
    Bueno-Gonzalez et al. 2020
  • Pseudomonas kitaguniensis
    Sawada et al. 2020
  • シュードモナス・ナックムッシイ
    Pseudomonas knackmussii
    Stolz et al. 2007
  • シュードモナス・コーリエンシス
    (シュードモナス・コレエンシス)
    Pseudomonas koreensis
    Kwon et al. 2003
  • Pseudomonas kulmbachensis
    Lick et al. 2024
  • Pseudomonas kurunegalensis
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・クイケンダリイ
    Pseudomonas kuykendallii
    Hunter and Manter 2012
  • Pseudomonas lactis
    von Neubeck et al. 2017
  • Pseudomonas lactucae
    Sawada et al. 2021
  • Pseudomonas lalkuanensis
    Thorat et al. 2020
  • Pseudomonas lalucatii
    Busquets et al. 2021
  • Pseudomonas laurentiana
    Wright et al. 2019
  • Pseudomonas laurylsulfatiphila
    corrig. Furmanczyk et al. 2019
  • Pseudomonas laurylsulfativorans
    corrig. Furmanczyk et al. 2019
  • Pseudomonas leptonychotis
    Nováková et al. 2020
  • シュードモナス・リバネンシス
    Pseudomonas libanensis
    Dabboussi et al. 1999
  • Pseudomonas lijiangensis
    Lu et al. 2022
  • シュードモナス・リニ
    Pseudomonas lini
    Delorme et al. 2002
  • シュードモナス・リニインゲンシス
    Pseudomonas linyingensis
    He et al. 2015
  • シュードモナス・ルンデンシス
    Pseudomonas lundensis
    Molin et al. 1986
  • シュードモナス・ルリダ
    Pseudomonas lurida
    Behrendt et al. 2007
  • シュードモナス・ルテア
    Pseudomonas lutea
    Peix et al. 2004
  • シュードモナス・マンデリイ
    Pseudomonas mandelii
    Verhille et al. 1999
  • Pseudomonas mangiferae
    Anurat et al. 2019
  • Pseudomonas mangrovi
    Ye et al. 2019
  • シュードモナス・マルギナリス
    Pseudomonas marginalis
    (Brown 1918)
    Stevens 1925
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas marianensis
    Yang et al. 2023
  • シュードモナス・マリンコラ
    Pseudomonas marincola
    Romanenko et al. 2008
  • Pseudomonas marvdashtae
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas matsuisoli
    Lin et al. 2015
  • Pseudomonas maumuensis
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・メディテラネア
    Pseudomonas mediterranea
    Catara et al. 2002
  • シュードモナス・メンドシナ
    Pseudomonas mendocina
    Palleroni 1970
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・メリディアナ
    Pseudomonas meridiana
    Reddy et al. 2004
  • シュードモナス・ミグラエ
    Pseudomonas migulae
    Verhille et al. 1999
  • シュードモナス・モーニイ
    Pseudomonas mohnii
    Cámara et al. 2007
  • Pseudomonas monsensis
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・モンテイリイ
    Pseudomonas monteilii
    Elomari et al. 1997
  • シュードモナス・モーレイ
    Pseudomonas moorei
    Cámara et al. 2007
  • シュードモナス・モラヴィエンシス
    Pseudomonas moraviensis
    Tvrzová et al. 2006
  • Pseudomonas morbosilactucae
    Sawada et al. 2022
  • シュードモナス・モッセリイ
    Pseudomonas mosselii
    Dabboussi et al. 2002
  • シュードモナス・ムシドレンス
    Pseudomonas mucidolens
    Levine and Anderson 1932
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas mucoides
    Duman et al. 2021
  • Pseudomonas muyukensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas nabeulensis
    Oueslati et al. 2020
  • Pseudomonas neuropathica
    Duman et al. 2021
  • Pseudomonas neustonica
    Jang et al. 2020
  • Pseudomonas nicosulfuronedens
    Li et al. 2021
  • シュードモナス・ニトロレデュセンス
    Pseudomonas nitroreducens
    Iizuka and Komagata 1964
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas nunensis
    Ntana et al. 2023
  • Pseudomonas ogarae
    Garrido-Sanz et al. 2022
  • シュードモナス・オレオヴォランス
    Pseudomonas oleovorans
    Lee and Chandler 1941
    (Approved Lists 1980)
    • シュードモナス・オレオヴォランス亜種ルブリカンティス
      Pseudomonas oleovorans subsp. lubricantis
      Saha et al. 2010
    • シュードモナス・オレオヴォランス亜種オレオヴォランス
      Pseudomonas oleovorans subsp. oleovorans
      (Lee and Chandler 1941)
      Saha et al. 2010
  • シュードモナス・オリエンタリス
    Pseudomonas orientalis
    Dabboussi et al. 2002
  • Pseudomonas oryzagri
    Huq et al. 2022
  • Pseudomonas oryzicola
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・オリジハビタンス
    Pseudomonas oryzihabitans
    Kodama et al. 1985
  • シュードモナス・オティティディス
    Pseudomonas otitidis
    Clark et al. 2006
  • Pseudomonas ovata
    Rao et al. 2021
  • シュードモナス・パレロニアナ
    Pseudomonas palleroniana
    Gardan et al. 2002
  • Pseudomonas palmensis
    Gutierrez-Albanchez et al. 2022
  • シュードモナス・パニパテンシス
    Pseudomonas panipatensis
    Gupta et al. 2008
  • Pseudomonas paracarnis
    Lick et al. 2021
  • Pseudomonas paraeruginosa
    Rudra et al. 2022
  • シュードモナス・パラフルバ
    Pseudomonas parafulva
    Uchino et al. 2002
  • Pseudomonas paralactis
    von Neubeck et al. 2017
  • Pseudomonas paralcaligenes
    Ono et al. 2023
  • Pseudomonas paraveronii
    Lick et al. 2024
  • Pseudomonas paraversuta
    Lick et al. 2021
  • シュードモナス・ペリ
    Pseudomonas peli
    Vanparys et al. 2006
  • Pseudomonas peradeniyensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas pergaminensis
    Díaz et al. 2022
  • Pseudomonas persica
    Keshavarz-Tohid et al. 2020
  • Pseudomonas petrae
    Nováková et al. 2023
  • Pseudomonas petroselini
    Sawada et al. 2022
  • Pseudomonas piscicola
    Duman et al. 2021
  • Pseudomonas pisciculturae
    Duman et al. 2021
  • Pseudomonas piscis
    Liu et al. 2020
  • シュードモナス・プレコグロシシダ
    (シュードモナス・プレコグロッシキダ)
    Pseudomonas plecoglossicida
    Nishimori et al. 2000
  • シュードモナス・ポアエ
    Pseudomonas poae
    Behrendt et al. 2003
  • シュードモナス・ポハンゲンシス
    Pseudomonas pohangensis
    Weon et al. 2006
  • Pseudomonas populi
    Anwar et al. 2016
  • Pseudomonas profundi
    Sun et al. 2018
  • Pseudomonas promysalinigenes
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas prosekii
    Kosina et al. 2014
  • シュードモナス・プロトゲンス
    Pseudomonas protegens
    Ramette et al. 2012
  • シュードモナス・プロテオリティカ
    Pseudomonas proteolytica
    Reddy et al. 2004
  • シュードモナス・サイクロフィラ
    Pseudomonas psychrophila
    Yumoto et al. 2002
  • シュードモナス・サイクロトレランス
    Pseudomonas psychrotolerans
    Hauser et al. 2004
  • シュードモナス・プノネンシス
    Pseudomonas punonensis
    Ramos et al. 2013
  • シュードモナス・プチダ
    Pseudomonas putida
    (Trevisan 1889) Migula 1895
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas quasicaspiana
    Carvalho et al. 2022
  • Pseudomonas quebecensis
    Tambong et al. 2023
  • Pseudomonas quercus
    Li et al. 2021
  • Pseudomonas reidholzensis
    Frasson et al. 2017
  • シュードモナス・レイネケイ
    Pseudomonas reinekei
    Cámara et al. 2007
  • シュードモナス・レシノボランス
    Pseudomonas resinovorans
    Delaporte et al. 1961
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas rhizoryzae
    Wang et al. 2020
  • シュードモナス・リゾスファエラエ
    Pseudomonas rhizosphaerae
    Peix et al. 2003
  • シュードモナス・ローデシアエ
    Pseudomonas rhodesiae
    Coroler et al. 1997
  • Pseudomonas rubra
    Testerman et al. 2023
  • Pseudomonas rustica
    Fiedler et al. 2022
  • Pseudomonas sagittaria
    Lin et al. 2013
  • Pseudomonas saliphila
    Zhang et al. 2021
  • Pseudomonas salmasensis
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・サロモニイ
    Pseudomonas salomonii
    Gardan et al. 2002
  • シュードモナス・サポニフィラ
    Pseudomonas saponiphila
    Lang et al. 2012
  • シュードモナス・サバスタノイ
    Pseudomonas savastanoi
    (Janse 1982 ex Smith 1908)
    Gardan et al. 1992
  • Pseudomonas saxonica
    Hofmann et al. 2020
  • Pseudomonas schmalbachii
    Shelomi et al. 2021
  • シュードモナス・セゲティス
    Pseudomonas segetis
    Park et al. 2006
  • シュードモナス・セレニイプラエキピタンス
    Pseudomonas seleniipraecipitans
    corrig. Hunter and Manter 2011
  • Pseudomonas serbica
    Todorović et al. 2023
  • Pseudomonas serboccidentalis
    Todorović et al. 2023
  • Pseudomonas sesami
    Madhaiyan et al. 2017
  • Pseudomonas sessilinigenes
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas shahriarae
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas shirazensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas sichuanensis
    Qin et al. 2019
  • Pseudomonas silesiensis
    Kaminski et al. 2018
  • Pseudomonas siliginis
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・シミアエ
    Pseudomonas simiae
    Vela et al. 2006
  • Pseudomonas sivasensis
    Duman et al. 2020
  • Pseudomonas solani
    Sawada et al. 2023
  • Pseudomonas soli
    Pascual et al. 2015
  • Pseudomonas spelaei
    Švec et al. 2020
  • シュードモナス・ストラミネア
    Pseudomonas straminea
    corrig. Iizuka and Komagata 1963
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・スタッツェリ
    (シュードモナス・ステュツェリ)
    Pseudomonas stutzeri
    (Lehmann and Neumann 1896) Sijderius 1946
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・シンキサンサ
    Pseudomonas synxantha
    (Ehrenberg 1840) Holland 1920
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・シリンガエ
    Pseudomonas syringae
    van Hall 1902
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・タエアネンシス
    Pseudomonas taeanensis
    Lee et al. 2010
  • シュードモナス・タエトロレンス
    Pseudomonas taetrolens
    Haynes 1957
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・タイワネンシス
    Pseudomonas taiwanensis
    Wang et al. 2010
  • Pseudomonas tehranensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas tensinigenes
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・サーモトレランス
    Pseudomonas thermotolerans
    Manaia and Moore 2002
  • シュードモナス・チベルバレンシス
    Pseudomonas thivervalensis
    Achouak et al. 2000
  • Pseudomonas tianjinensis
    Chen et al. 2018
  • Pseudomonas tohonis
    Yamada et al. 2021
  • シュードモナス・トラーシイ
    Pseudomonas tolaasii
    Paine 1919
    (Approved Lists 1980)
  • シュードモナス・トヨトミエンシス
    Pseudomonas toyotomiensis
    Hirota et al. 2011
  • シュードモナス・トレマエ
    Pseudomonas tremae
    Gardan et al. 1999
  • Pseudomonas triclosanedens
    Yin et al. 2024
  • Pseudomonas tritici
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas triticicola
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas triticifolii
    Tambong et al. 2022
  • シュードモナス・トリビアリス
    Pseudomonas trivialis
    Behrendt et al. 2003
  • Pseudomonas tructae
    Oh et al. 2019
  • Pseudomonas turukhanskensis
    Korshunova et al. 2016
  • Pseudomonas typographi
    Peral-Aranega et al. 2021
  • Pseudomonas ullengensis
    Kim et al. 2021
  • シュードモナス・ウムソンゲンシス
    Pseudomonas umsongensis
    Kwon et al. 2003
  • Pseudomonas urmiensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas uvaldensis
    Khanal et al. 2022
  • シュードモナス・バンコウベレンシス
    Pseudomonas vancouverensis
    Mohn et al. 1999
  • Pseudomonas vanderleydeniana
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・ベロニイ
    Pseudomonas veronii
    Elomari et al. 1996
  • Pseudomonas versuta
    See-Too et al. 2017
  • Pseudomonas viciae
    Zhao et al. 2020
  • シュードモナス・ビリディフラバ
    Pseudomonas viridiflava
    (Burkholder 1930) Dowson 1939
    (Approved Lists 1980)
  • Pseudomonas vlassakiae
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・ヴラノヴェンシス
    Pseudomonas vranovensis
    Tvrzová et al. 2006
  • Pseudomonas wadenswilerensis
    Frasson et al. 2017
  • Pseudomonas wayambapalatensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas weihenstephanensis
    von Neubeck et al. 2016
  • Pseudomonas xantholysinigenes
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・キサントマリナ
    Pseudomonas xanthomarina
    Romanenko et al. 2005
  • Pseudomonas xanthosomatis
    corrig. Girard et al. 2022
  • Pseudomonas xionganensis
    Zhao et al. 2020
  • Pseudomonas yamanorum
    Arnau et al. 2015
  • Pseudomonas yangonensis
    Tohya et al. 2020
  • Pseudomonas zanjanensis
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas zarinae
    Girard et al. 2022
  • Pseudomonas zeae
    Girard et al. 2022
  • シュードモナス・ゼシュイイ
    Pseudomonas zeshuii
    Feng et al. 2012

シュードモナス属(シュードモナスぞく、Pseudomonas)とは、Pseudomonadotaガンマプロテオバクテリア綱シュードモナス科に属する、グラム陰性好気性桿菌の属である[5]。本来のラテン語読みであるプセウドモナスと呼ばれることもある(シュードモナスは英語発音に近い)。過去にはプソイドモナスと呼ばれていたこともあった[6]。病院内において多剤耐性を獲得しその感染症が問題になる緑膿菌P. aeruginosa)を含む。シュードモナス属である菌株をシュードモナス属菌: pseudomonad)という。現在、218の種と18の亜種が知られている[7]

特徴

この属は異化特性が非常に多様であり、このため幅広いニッチに生息している[8]in vitroでの培養が容易である点とゲノムDNA増幅が可能である点により学術的研究において重要視とされており、人間に対する日和見感染院内感染の原因菌であるP. aeruginosa植物の病害や霜害の原因菌であり一方で生物防除用や人工降雪用として注目されているP. syringae、生物として世界で初めて特許登録された土壌微生物であり油分汚染に対するバイオレメディエーションに有用なP. putida、植物病原性を持たず植物生長を促進するP. fluorescensなどが特に研究されている。

水圏や、双子葉類といった植物の種子にも見出せるため、シュードモナス属は微生物学の歴史の初期において認識されていた。シュードモナスという言葉は、シュードモナスを発見したと主張した[ : Walter Migula(英語版) ]が1894年から1900年に、グラム陰性で桿状の極鞭毛を持った細菌というあいまいな定義をして生まれた[9][10](のちにWalterの発見は微粒子の見間違いであることが証明された[11])。

分類学的特徴

分子生物学的な分類手法が登場する以前の、形態学的にシュードモナス属を定義していた特徴は以下である[12]

その他のシュードモナス属一般の特徴として以下が挙げられる。グルコースを用いたヒュー・レイフソンテスト[注釈 1]においてガス形成はしない。血液寒天培地上でベータ溶血性を示す。インドールテストとメチルレッド、Voges–Proskauerテストに陰性であり、クエン酸テストに陽性である。

分布

その生息域は幅広く、土壌、淡水、海水、植物動物(ヒト、家畜魚介類を含む)の組織、天然の、雲などを含む。石油農薬(殺菌剤)、重金属などで汚染された環境においても生育する株も存在する。P. putida IH-2000は高濃度のトルエン中においても生存できる。

様々な有機化合物を分解する能力があり、自然界における分解者であるため、地球上の炭素循環に大きく貢献していると考えられている。

シュードモナス属菌は霜や雲にも分布している。霜や雲を形成する核(凍結核)としてシュードモナス属菌は最も一般的である。一部のシュードモナス属菌が凍結核となる理由は、細胞膜中に氷核活性[ : ice nucleation-active ](Ina)タンパク質を産生する[13][14]性質による。Inaタンパク質は比較的高い温度(-4 ℃から-2 ℃)で水の凍結を促進する。

凍結核となる性質はシュードモナス属菌の重要性の一つである。シュードモナス属菌は世界中のの発生に最も重要であると考えられている[15]P. syringaeは、植物の霜害における最も大きな原因であると同定されている。Inaタンパク質は人工雪の生産に用いられている[16]

色素の産生

シュードモナス属菌の多くは蛍光色素を産生する。その多くはピオベルジン[ : pyoverdine(英語版) ](黄緑色の蛍光性のシデロホアであり、栄養としての鉄分が不足している条件下で分泌される[17]。また、一部の種はピオベルジン以外のシデロホア分子を分泌する。Pseudomonas aeruginosaを含むシュードモナス属病原性菌はピオシアニン[ : pyocyanin(英語版) ](青緑色)を分泌する[18]Pseudomonas fluorescensはチオキノロバクチン[ : thioquinolobactin ][19]を分泌する。P. fluorescensグループの種は一般に緑色気味の水溶性色素を産生する。

バイオフィルムの形成

相当数のシュードモナス属菌が存在するとき、アルギン酸といった菌体外多糖[ : exopolysaccharide(英語版) ]の分泌によりバイオフィルムが形成される。バイオフィルムはシュードモナス属菌にとって都合のよい生息場所となり、また、外敵や物理的ストレスから保護する。例えば、哺乳類白血球による貪食[20]や、(食品に繁殖したシュードモナス属菌の)調理による除去を困難にする。

日和見感染の病原菌であるP. aeruginosaによるバイオフィルムの形成は、遺伝性疾患である嚢胞性線維症(CF)患者に対するP. aeruginosa感染の原因となる。このバイオフィルムは気道内の粘液に形成され、P. aeruginosaの生息場所となる。それに加え、CF病患者のバイオフィルムに生息するP. aeruginosaは(歴史的に、全てのシュードモナス属菌は偏性好気性生物に分類されていたにもかかわらず)嫌気呼吸を行うようになる[21]

薬剤耐性

グラム陰性菌であるため、大部分のシュードモナス属は本質的にペニシリンやその他のβ-ラクタム系抗生物質に対して耐性を持つが、ピペラシリン、イミペネム、チカルシリン、またはシプロフロキサシンに対して感受性を持つ[20]。このため、これらの抗生物質は治療に用いられるが、その他、トブラマイシン、ゲンタマイシンアミカシンのようなアミノグリコシド系抗生物質が治療に用いられる(アミノグリコシド系抗生物質#抗緑膿菌作用のあるもの)。

P. aeruginosa(緑膿菌)は、臨床現場における日和見感染病原体である。抗生物質に対して低感受性であるため警戒されている[22]。この低感受性は、染色体にコードされた薬剤耐性遺伝子(例えば、 mexAB-OPRMmexXYなど[23])による多剤排出ポンプ[ : Bacterial efflux pumps(英語版) ]、および細菌細胞のエンベロープの低透過性に起因する。多剤排出ポンプは細胞壁中の膜貫通タンパク質ポリンであり、抗生物質が効果を現す前にこれを細胞外へ排出する。

P. aeruginosaが抗生物質の低感受性と抵抗性を獲得することがある。染色体の遺伝子の突然変異および、抗生物質抵抗性の決定因子の水平伝播はその原因となり、多剤耐性の発生も引き起こす。また、体細胞超変異は、慢性の感染症を引き起こす緑膿菌株の薬剤耐性獲得の原因の一つとなる。また、インテグロン[注釈 2]中にいくつかの異なる薬剤耐性遺伝子が集まっており、薬剤耐性決定因子の獲得につながる。複数の研究は、バイオフィルムの形成または変異体の小コロニーの出現に関連する耐性表現型が緑膿菌の抗生物質処理への応答において重要である可能性を示している[24]

病原性

動物に対する病原性

詳細は「en:Pseudomonas infection」を参照

シュードモナス属の感染性種はP. aeruginosa(緑膿菌)やP. oryzihabitansP. plecoglossicidaなどである。緑膿菌は非常に広大な分泌系を有しており、院内感染の原因は緑膿菌が分泌する多数のタンパク質であると考えられている[25]

植物に対する病原性

  • P. syringae植物に対して非常に多くの疾病をもたらす病原体である。宿主植物に高度に特異的である、50種類の病原型が存在する。他のシュードモナス属菌の多く、とりわけP. syringae亜種は植物に対する病原体であるが、植物病原体としてP.syringaeが最も一般的であり、最もよく研究されている。
  • 厳密には植物病原体ではないが、P. tolaasiiは栽培キノコにしみを生じさせる[26]。このため農業において問題視されている主要なシュードモナス菌のひとつである。
  • P. agariciは、垂れたのような外見の変化を栽培キノコに与える[27]
  • P. tomatoは多様な病原型を持ち、様々な植物に感染する。トマトに感染して果実を実らないようにする病原型のほか、それぞれ、キュウリセロリキンギョソウパッションフルーツなどに感染する病原型が存在する。

バイオレメディエーションへの利用

一部の種は環境中の化学汚染物質を代謝することができるため、バイオレメディエーションに利用することができる。バイオレメディエーション剤として適切であると実証された種として以下が含まれている。

生物防除への利用

1980年代半ば以降、農作物への病原菌の繁殖を防止するためシュードモナス属の特定の菌株が穀物種子または農耕地に散布されている。このような行為は一般的に生物防除と呼ばれている。P. fluorescensP. protegens(CHA0株やPf-5株など)の生物防除特性が現在のところ最もよく理解されている。ただし、P. fluorescensがどのように植物生長促進効果を実現しているかは明確になっていない。一つの理論として、宿主植物への全身抵抗性を誘導し、宿主植物が本当の病原体に対してより強い抵抗性を示すようになり、一方でP. fluorescensが生存競争で土壌病原微生物を抑えるためと考えられている。P. fluorescensが他の微生物よりも生存競争で優勢となる理由として、キレート剤であるシデロホアを利用するため鉄分の獲得競争で有利になるためや、フェナジン系の抗生物質シアン化水素のような他の土壌微生物を抑制する化合物を生産するためと考えられている。2005年に行われた研究結果はこの理論を支持している[36]

生物防除特性で注目すべきその他のシュードモナス菌種として、特定の植物病原性真菌に対して働くフェナジン系の抗生物質を産生するP. chlororaphis[37]や、その近縁種であり、グラム陽性微生物に対して働く抗生物質di-2,4-diacetylfluoroglucylmethaneを産生するP. aurantiaca[38]がある。

食品の腐敗への関連

シュードモナス属の代謝多様性と、低温での生育能力と、非常に広範な分布とにより、多くのシュードモナス属菌種は食品の腐敗の一般的な原因である。代表的な例として、P. fragiによる肉類や酪農製品の腐敗[39]P. taetrolensP. mudicolensによるからのカビの発生[40]P. lundensisによる牛乳チーズ牛肉魚肉の腐敗が挙げられる[41]。シュードモナスの増殖による食品の腐敗は果実のような臭気を生じさせる。

分類の歴史

シュードモナス属という語は19世紀末にWalter Migulaによって創られた。当時、この属名の語源は説明されなかったが、: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology(英語版)第7版(当時における、細菌の学名命名法および分類法の標準だった書籍[42])では、ギリシャ語におけるpseudes=「偽物の」(ψευδής)と-monas=「単一単位」(μονάς/μονάδος)の合成語であると記述されている。しかしながら、おそらくMigulaは「偽物の[ : Monas(英語版) ](微小な鞭毛をもつ原生生物)」を意図して名づけたと考えられている[11]

Migulaの定義から数十年でこの属に割り当てられた種名の数は膨大となり、問題となった。Migulaの定義はあいまいであり、一致する種が非常に多かったためである。しかし、多くの株は、種間で保存された高分子(タンパク質核酸など)に基づく方法や新しい分類法に基づいて再分類された[24]。例えば、リボソームRNAの配列や組成の類似性に基づいた分類法は、そのような分子生物学的手法がまだなかった当時に分類された種で構成されたシュードモナス属が、5つのいわゆるrRNAホモロジーグループ、すなわち異なる属に明確に分離できることを明確に示した。現在登録されている種の数は、当時と比べて90%以上減少している。

2000年に16S rRNA系統解析により多くの細菌種が再分類された[43]。その結果、以前は Chryseomonas属と Flavimonas属に分類されていた株をシュードモナス属は含むことになった[44]。シュードモナス属とされていた一部の株はBurkholderia属またはRalstonia属に分類されなおされている[45][46]

2000年には、シュードモナス属に分類されている一種のゲノム配列決定が完了した。より最近では、P. aeruginosa PAO1 (2000)、P. putida KT2440 (2002)、P. protegens Pf-5 (2005)、P. syringae pathovar tomato DC3000 (2003)、P. syringae pathovar syringae B728a (2005)、P. syringae pathovar phaseolica 1448A (2005)、P. fluorescens Pf0-1、P. entomophila L48を含む様々なシュードモナス菌株のゲノム配列決定がなされた[24]

過去にシュードモナス属に分類されていた種

シュードモナス属は現在、ガンマプロテオバクテリア綱に分類されている。

アルファプロテオバクテリア綱

P. abikonensis(現Sphingomonas abikonensis)、P. aminovorans(現Aminobacter aminovorans)、P. azotocolligans(現Sphingomonas trueperi)、P. carboxydohydrogena(現Bradyrhizobium属)、P. carboxidovorans(現Oligotropha carboxidovorans)、P. compransoris(現Zavarzinia compransoris)、P. diminuta(現Brevundimonas diminuta)、P. echinoides(現Sphingomonas echinoides)、P. extorquens(現Methylobacterium extorquens)、P. lindneri(現Zymomonas mobilis)、P. mesophilica(現Methylobacterium mesophilicum)、P. paucimobilis(現Sphingomonas paucimobilis)、P. radiora(現Methylobacterium radiotolerans)、P. rhodos(現Methylobacterium rhodinum)、P. riboflavina(現Devosia riboflavina)、P. rosea(現Methylobacterium extorquens)、P. vesicularis(現Brevundimonas vesicularis)

ベータプロテオバクテリア綱

P. acidovorans(現Comamonas acidovorans)、P. alliicola(現Burkholderia gladioli)、P. antimicrobica(現Burkholderia gladioli)、P. avenae(現Acidovorax avenae)、P. butanovorae(現Thauera属)、P. caryophylli(現Burkholderia caryophylli)、P. cattleyae(現Acidovorax avenae)、P. cepacia(現Burkholderia cepacia)、P. cocovenenans(現Burkholderia cocovenenans)、P. delafieldii(現Acidovorax delafieldii)、P. facilis(現Acidovorax facilis)、P. flava(現Hydrogenophaga flava)、P. gladioli(現Burkholderia gladioli)、P. glathei(現Burkholderia glathei)、P. glumae(現Burkholderia glumae)、P. graminis(現Burkholderia graminis)、P. huttiensis(現Herbaspirillum huttiense)、P. indigofera(現Vogesella indigofera)、P. lanceolata(現Comamonadaceae属)、P. lemoignei(現Paucimonas lemoignei)、P. mallei(現Burkholderia mallei)、P. mephitica(現Janthinobacterium lividum)、P. mixta(現Telluria mixta)、P. palleronii(現Hydrogenophaga palleronii)、P. phenazinium(現Burkholderia phenazinium)、P. pickettii(現Ralstonia pickettii)、P. plantarii(現Burkholderia plantarii)、P. pseudoflava(現Hydrogenophaga pseudoflava)、P. pseudomallei(現Burkholderia pseudomallei)、P. pyrrocinia(現Burkholderia pyrrocinia)、P. rubrilineans(現Acidovorax avenae)、P. rubrisubalbicans(現Herbaspirillum rubrisubalbicans)、P. saccharophila(現Matsuebacter属)、P. solanacearum(現Ralstonia solanacearum)、P. spinosa(現Hydrogenophaga属)、P. syzygii(現Ralstonia syzygii)、P. taeniospiralis(現Hydrogenophaga taeniospiralis)、P. terrigena(現Comamonas terrigena)、P. testosteroni(現Comamonas testosteroni)

ガンマ-ベータプロテオバクテリア

P. beteli(現Stenotrophomonas属)、P. boreopolis(現Xanthomonas属)、P. cissicola(現Xanthomonas属)、P. geniculata(現Stenotrophomonas属)、P. hibiscicola(現Stenotrophomonas属)、P. maltophilia(現Stenotrophomonas maltophilia)、P. pictorum(現Stenotrophomonas属)

ガンマプロテオバクテリア綱

P. beijerinckii(現Chromohalobacter)、P. diminuta(現Brevundimonas diminuta)、P. doudoroffii(Aeromonas属)、P. elongata(現Microbulbifer elongatus)、P. flectens(Enterobacteriaceae属)、P. halodurans(現Halomonas halodurans)、P. halophila(現Marinobacter属)、P. iners(現Marinobacterium georgiense)、P. marina(現Halomonadaceae属)、P. nautica(現Marinobacter hydrocarbonoclasticus)、P. nigrifaciens(現Pseudoalteromonas nigrifaciens)、P. pavonacea(現Acinetobacter)[47]P. piscicida(現Pseudoalteromonas piscicida)、P. stanieri(現Marinobacterium stanieri)

イプシロンプロテオバクテリア綱

P. formicans(現Aeromonas caviae)

グループ

2000年に行われた16S rRNA系統解析により、シュードモナス属136種は5つのグループに分割され、各グループに種が分類された。

P. aeruginosa グループ

  • P. aeruginosa(緑膿菌)
  • P. alcaligenes
  • P. anguilliseptica
  • P. argentinensis
  • P. borbori
  • P. citronellolis
  • P. flavescens
  • P. mendocina
  • P. nitroreducens
  • P. oleovorans
  • P. pseudoalcaligenes
  • P. resinovorans
  • P. straminea

P. chlororaphis グループ

  • P. agarici
  • P. asplenii
  • P. aurantiaca
  • P. aureofaciens
  • P. chlororaphis
  • P. corrugata
  • P. fragi
  • P. lundensis
  • P. taetrolens

P. fluorescens グループ

  • P. antarctica
  • P. azotoformans
  • P. blatchfordae
  • P. brassicacearum
  • P. brenneri
  • P. cedrina
  • P. corrugata
  • P. fluorescens
  • P. gessardii
  • P. libanensis
  • P. mandelii
  • P. marginalis
  • P. mediterranea
  • P. meridiana
  • P. migulae
  • P. mucidolens
  • P. orientalis
  • P. panacis
  • P. protegens
  • P. proteolytica
  • P. rhodesiae
  • P. synxantha
  • P. thivervalensis
  • P. tolaasii
  • P. veronii

P. pertucinogena グループ

  • P. denitrificans
  • P. pertucinogena

P. putida グループ

  • P. cremoricolorata
  • P. entomophila
  • P. fulva
  • P. monteilii
  • P. mosselii
  • P. oryzihabitans
  • P. parafulva
  • P. plecoglossicida
  • P. putida

P. stutzeri グループ

P. syringae グループ

  • P. amygdali
  • P. avellanae
  • P. caricapapayae
  • P. cichorii
  • P. coronafaciens
  • P. ficuserectae
  • P. helianthi
  • P. meliae(センダンこぶ病菌)
  • P. savastanoi
  • P. syringae(ムギ類黒節病菌)
  • P. tomato
  • P. viridiflava

所在位置不明

  • P. abietaniphila
  • P. acidophila
  • P. agarici
  • P. alcaliphila
  • P. alkanolytica
  • P. amyloderamosa
  • P. asplenii
  • P. azotifigens
  • P. cannabina
  • P. coenobios
  • P. congelans
  • P. costantinii
  • P. cruciviae
  • P. delhiensis
  • P. excibis
  • P. extremorientalis
  • P. frederiksbergensis
  • P. fuscovaginae
  • P. gelidicola
  • P. grimontii
  • P. indica
  • P. jessenii
  • P. jinjuensis
  • P. kilonensis
  • P. knackmussii
  • P. koreensis
  • P. lini
  • P. lutea
  • P. moraviensis
  • P. otitidis
  • P. pachastrellae
  • P. palleroniana
  • P. papaveris
  • P. peli
  • P. perolens
  • P. poae
  • P. pohangensis
  • P. protegens
  • P. psychrophila
  • P. psychrotolerans
  • P. rathonis
  • P. reptilivora
  • P. resiniphila
  • P. rhizosphaerae
  • P. rubescens
  • P. salomonii
  • P. segitis
  • P. septica
  • P. simiae
  • P. suis
  • P. thermotolerans
  • P. toyotomiensis
  • P. tremae
  • P. trivialis
  • P. turbinellae
  • P. tuticorinensis
  • P. umsongensis
  • P. vancouverensis
  • P. vranovensis
  • P. xanthomarina

シュードモナス属に感染するバクテリオファージ

シュードモナス属に感染するバクテリオファージの例として以下がある。

  • : Pseudomonas phage Φ6(英語版)
  • Pseudomonas aeruginosa phage EL [48]
  • : Pseudomonas aeruginosa phage ΦKMV(英語版)[49]
  • : Pseudomonas aeruginosa phage LKD16(英語版)[50]
  • : Pseudomonas aeruginosa phage LKA1(英語版)[50]
  • : Pseudomonas aeruginosa phage LUZ19(英語版)
  • Pseudomonas aeruginosa phage ΦKZ [48]

注釈

  1. ^ ヒュー・レイフソンテスト(Hugh and Leifson test)とは、炭水化物(ブドウ糖乳糖ショ糖など)の分解形式が酸化か発酵かを判別する酸化対発酵試験(O/Fテスト)法である。炭水化物を最終濃度1%になるようにOF基本培地に加えた半流動培地を2組用意する。試験細菌を穿刺培養したあと、一方の組を好気的に培養し、他方の組を滅菌流動パラフィンの重層で嫌気的に培養する。炭水化物が分解されると産生される酸をpH指示薬で検出し、検出される場所が空気(酸素)に触れる場所ならばその分解は酸化または発酵、触れない場所ならば発酵のみと判断する。Rudolph Hugh; Einar Leifson (1953). “The taxonomic significance of fermentative verus oxidative metabolism of carbohydrates by various Gram-negative bacteria”. Journal of Bacteriology 66 (1): 24-26. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC357086/. 
  2. ^ インテグロン[ : integron(英語版) ]:薬剤耐性遺伝子の細菌間の伝播に関与していることが知られている、グラム陰性細菌に広く存在する可動性遺伝因子。島本整 (2003-2004). “病原細菌のゲノム進化におけるレトロンとインテグロンの役割”. 旧ゲノム特定領域 最終報告書データ 領域3 細胞システム解明に向けたゲノム生物学の新展開 pages=282-283. http://lifesciencedb.jp/houkoku/pdf/001/c062.pdf. 

参考文献

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脚注

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関連項目

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