Klasifikasi virus
Klasifikasi virus adalah proses pemberian nama dan pengelompokan virus berdasarkan karakter yang dimilikinya. Ada beberapa cara mengelompokkan virus, misalnya berdasarkan karakteristik fenotipe mereka, seperti morfologi, jenis asam nukleat, cara replikasi, organisme inang, serta jenis penyakit yang mereka timbulkan. Secara formal, klasifikasi taksonomi virus merupakan wewenang dan tanggung jawab Komite Internasional Taksonomi Virus (ICTV). Meskipun demikian, sistem klasifikasi Baltimore juga sering kali digunakan untuk memudahkan pengelompokan virus. Sistem ini membagi virus menjadi tujuh grup berdasarkan cara mereka menyintesis mRNA. Konvensi pemberian nama yang spesifik dan pedoman untuk klasifikasi lebih lanjut ditetapkan oleh ICTV.
Klasifikasi ICTV
Seperti taksonomi makhluk hidup pada umumnya, klasifikasi virus juga dilakukan secara hierarkis atau bertingkat. Sistem klasifikasi virus yang diusulkan oleh ICTV saat ini yaitu:[1]
- Dunia (-viria)
- Subdunia (-vira)
- Kerajaan (-viriae)
- Subkerajaan (-virites)
- Filum (-viricota)
- Subfilum (-viricotina)
- Kelas (-viricetes)
- Subkelas (-viricetidae)
- Ordo (-virales)
- Subordo (-virineae)
- Famili (-viridae)
- Subfamili (-virinae)
- Genus (-virus)
- Subgenus (-virus)
- Spesies
- Subgenus (-virus)
- Genus (-virus)
- Subfamili (-virinae)
- Famili (-viridae)
- Subordo (-virineae)
- Ordo (-virales)
- Subkelas (-viricetidae)
- Kelas (-viricetes)
- Subfilum (-viricotina)
- Filum (-viricota)
- Subkerajaan (-virites)
- Kerajaan (-viriae)
- Subdunia (-vira)
Dalam klasifikasi virus, terdapat banyak takson yang dikategorikan sebagai incertae sedis atau penempatannya tidak pasti. Pada tahun 2019, 4 dunia, 9 kerajaan, 16 filum, 2 subfilum, 36 kelas, 55 ordo, 8 subordo, 168 famili, 103 subfamili, 1.421 genus, 68 subgenus, dan 6.589 spesies virus telah ditetapkan oleh ICTV.[2] Klasifikasi virus hingga ke tingkat famili dapat dilihat pada tabel di bawah ini.
| Dunia | Kerajaan | Filum | Kelas | Ordo | Famili |
|---|---|---|---|---|---|
| Duplodnaviria | Heunggongvirae | Peploviricota | Herviviricetes | Herpesvirales | Alloherpesviridae, Herpesviridae, Malacoherpesviridae |
| Uroviricota | Caudoviricetes | Caudovirales | Ackermannviridae, Autographiviridae, Chaseviridae, Demerecviridae, Drexlerviridae, Herelleviridae, Myoviridae, Podoviridae, Siphoviridae | ||
| Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales | Inoviridae, Plectroviridae |
| Sangervirae | Phixviricota | Malgrandaviricetes | Petitvirales | Microviridae | |
| Shotokuvirae | Cossaviricota | Mouviricetes | Polivirales | Bidnaviridae | |
| Papovaviricetes | Sepolyvirales | Polyomaviridae | |||
| Zurhausenvirales | Papillomaviridae | ||||
| Quintoviricetes | Piccovirales | Parvoviridae | |||
| Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales | Bacilladnaviridae | ||
| Cirlivirales | Circoviridae | ||||
| Cremevirales | Smacoviridae | ||||
| Mulpavirales | Nanoviridae | ||||
| Recrevirales | Redondoviridae | ||||
| Repensiviricetes | Geplafuvirales | Geminiviridae, Genomoviridae | |||
| Trapavirae | Saleviricota | Huolimaviricetes | Haloruvirales | Pleolipoviridae | |
| Riboviria | Orthornavirae | Duplornaviricota | Chrymotiviricetes | Ghabrivirales | Chrysoviridae, Megabirnaviridae, Quadriviridae, Totiviridae |
| Resentoviricetes | Reovirales | Reoviridae | |||
| Vidaverviricetes | Mindivirales | Cystoviridae | |||
| Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales | Alphatetraviridae, Benyviridae, Hepeviridae, Matonaviridae | ||
| Martellivirales | Bromoviridae, Closteroviridae, Endornaviridae, Kitaviridae, Mayoviridae, Togaviridae, Virgaviridae | ||||
| Tymovirales | Alphaflexiviridae, Betaflexiviridae, Deltaflexiviridae, Gammaflexiviridae, Tymoviridae | ||||
| Flasuviricetes | Amarillovirales | Flaviviridae | |||
| Magsaviricetes | Nodamuvirales | Nodaviridae, Sinhaliviridae | |||
| Tolucaviricetes | Tolivirales | Carmotetraviridae, Luteoviridae, Tombusviridae | |||
| Lenarviricota | Allassoviricetes | Levivirales | Leviviridae | ||
| Amabiliviricetes | Wolframvirales | Narnaviridae | |||
| Howeltoviricetes | Cryppavirales | Mitoviridae | |||
| Miaviricetes | Ourlivirales | Botourmiaviridae | |||
| Negarnaviricota | Chunqiuviricetes | Muvirales | Qinviridae | ||
| Milneviricetes | Serpentovirales | Aspiviridae | |||
| Monjiviricetes | Jingchuvirales | Chuviridae | |||
| Mononegavirales | Artoviridae, Bornaviridae, Filoviridae, Lispiviridae, Mymonaviridae, Nyamiviridae, Paramyxoviridae, Pneumoviridae, Rhabdoviridae, Sunviridae, Xinmoviridae | ||||
| Yunchangviricetes | Goujianvirales | Yueviridae | |||
| Ellioviricetes | Bunyavirales | Arenaviridae, Cruliviridae, Fimoviridae, Hantaviridae, Leishbuviridae, Mypoviridae, Nairoviridae, Peribunyaviridae, Phasmaviridae, Phenuiviridae, Tospoviridae, Wupedeviridae | |||
| Insthoviricetes | Articulavirales | Amnoonviridae, Orthomyxoviridae | |||
| Pisuviricota | Duplopiviricetes | Durnavirales | Amalgaviridae, Hypoviridae, Partitiviridae, Picobirnaviridae | ||
| Pisoniviricetes | Nidovirales | Abyssoviridae, Arteriviridae, Coronaviridae, Cremegaviridae, Euroniviridae, Gresnaviridae, Medioniviridae, Mesoniviridae, Mononiviridae, Nanghoshaviridae, Nanhypoviridae, Olifoviridae, Roniviridae, Tobaniviridae | |||
| Picornavirales | Caliciviridae, Dicistroviridae, Iflaviridae, Marnaviridae, Picornaviridae, Polycipiviridae, Secoviridae, Solinviviridae | ||||
| Sobelivirales | Alvernaviridae, Barnaviridae, Solemoviridae | ||||
| Stelpaviricetes | Patatavirales | Potyviridae | |||
| Stellavirales | Astroviridae | ||||
| Incertae sedis | Incertae sedis | Incertae sedis | Birnaviridae, Permutotetraviridae | ||
| Pararnavirae | Artverviricota | Revtraviricetes | Blubervirales | Hepadnaviridae | |
| Ortervirales | Belpaoviridae, Caulimoviridae, Metaviridae, Pseudoviridae, Retroviridae | ||||
| Incertae sedis | Incertae sedis | Incertae sedis | Incertae sedis | Polymycoviridae, Sarthroviridae | |
| Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Megaviricetes | Algavirales | Phycodnaviridae |
| Imitervirales | Mimiviridae | ||||
| Pimascovirales | Ascoviridae, Iridoviridae, Marseilleviridae | ||||
| Pokkesviricetes | Asfuvirales | Asfarviridae | |||
| Chitovirales | Poxviridae | ||||
| Preplasmiviricota | Maveriviricetes | Priklausovirales | Lavidaviridae | ||
| Tectiliviricetes | Belfryvirales | Turriviridae | |||
| Kalamavirales | Tectiviridae | ||||
| Rowavirales | Adenoviridae | ||||
| Vinavirales | Corticoviridae | ||||
| Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales | Sphaerolipoviridae | |
| Incertae sedis | Incertae sedis | Incertae sedis | Incertae sedis | Ligamenvirales | Lipothrixviridae, Rudiviridae |
| Incertae sedis | Incertae sedis | Incertae sedis | Incertae sedis | Incertae sedis | Alphasatellitidae, Ampullaviridae, Anelloviridae, Avsunviroidae, Baculoviridae, Bicaudaviridae, Clavaviridae, Finnlakeviridae, Fuselloviridae, Globuloviridae, Guttaviridae, Halspiviridae, Hytrosaviridae, Nimaviridae, Nudiviridae, Ovaliviridae, Plasmaviridae, Polydnaviridae, Portogloboviridae, Pospiviroidae, Spiraviridae, Thaspiviridae, Tolecusatellitidae, Tristromaviridae |
Klasifikasi Baltimore
Sistem pengelompokan virus ini diajukan oleh David Baltimore, seorang ilmuwan asal Amerika Serikat. Ia membagi virus menjadi tujuh kategori berdasarkan jenis genom (DNA atau RNA) dan metode replikasinya.[3]
- Kelas I: DNA utas ganda
- Kelas II: DNA utas tunggal
- Kelas III: RNA utas ganda
- Kelas IV: RNA utas tunggal (+)
- Kelas V: RNA utas tunggal (-)
- Kelas VI: RNA utas tunggal (+) dengan DNA Intermediat
- Kelas VII: DNA utas ganda dengan RNA Intermediat
Referensi
- ^ ICTV (2018a). "ICTV Code: The International Code of Virus Classification and Nomenclature October 2018". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 16 Agustus 2019.
- ^ "Virus Taxonomy: 2019 Release". ICTV Online. Juli 2019. Diakses tanggal 7 Oktober 2020.
- ^ Baltimore D (1971). "Expression of animal virus genomes". Bacteriol Rev. 35 (3): 235–41. PMC 378387
. PMID 4329869.
Pranala luar
Wikispecies mempunyai informasi mengenai Virus.
- ICTV Diarsipkan 2017-02-03 di Wayback Machine.
- Master Species Lists Diarsipkan 2016-03-05 di Wayback Machine. pada situs web International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)
Klasifikasi virus (ICTV 2019) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Kategori •  Portal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
